奥野Gメンバーの研究論文が発表されました。

Sato N, Uchino E, Kojima R, Hiragi S, Yanagita M, Okuno Y*, Prediction and visualization of acute kidney injury in intensive care unit using one-dimensional convolutional neural networks based on routinely collected data. Computer Methods and Programs in Biomedicine. 206:106129, 2021 https://doi.org/10.1016/j.cmpb.2021.106129

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Chiba S, Lim KRQ, Sheri N, Anwar S, Erkut E, Shah MH, Aslesh T, Woo S, Sheikh O, Maruyama R, Takano H, Kunitake K, Duddy W, Okuno Y*, Aoki Y*, Yokota T*, eSkip-Finder: a machine learning-based web application and database to identify the optimal sequences of antisense oligonucleotides for exon skipping. Nucleic Acids Research. gkab442, 2021 https://doi.org/10.1093/nar/gkab442

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Mizota T, Hamada M, Shiraki A, Kikuchi T, Mineharu Y, Yamao Y, Hattori EY, Yonezawa A, Furukawa K, Arakawa Y. Factors associated with somnolence during brain function mapping in awake craniotomy. J. Clin. Neurosci. 2021;89:349–353. https://doi.org/10.1016/j.jocn.2021.05.050

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Tanaka Y, Higashihara K, Nakazawa M.A, Yamashita F, Tamada Y & Okuno Y. “Dynamic changes in gene-to-gene regulatory networks in response to SARS-CoV-2 infection” Sci Rep. 2021;11:11241. Available from: https://doi.org/10.1038/s41598-021-90556-1

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Nakamura K, Kojima R, Uchino E, Ono K, Yanagita M, Murashita K, Itoh K, Nakaji S & Okuno Y. “Health improvement framework for actionable treatment planning using a surrogate Bayesian model” Nat Commun. 2021;12:3088. Available from: https://doi.org/10.1038/s41467-021-23319-1

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Araki M, Matsumoto S, Bekker GJ, Isaka Y, Sagae Y, Kamiya N & Okuno Y. “Exploring ligand binding pathways on proteins using hypersound-accelerated molecular dynamics” Nat Commun. 2021;12:2793. Available from: https://doi.org/10.1038/s41467-021-23157-1

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Matsumoto S, Ishida S, Araki M, Kato T, Terayama K, Okuno Y. “Extraction of protein dynamics information from cryo-EM maps using deep learning” Nat Mach Intell. 2021;3:153-160. Available from: https://doi.org/10.1038/s42256-020-00290-y

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Iwata H, Matsuo T, Mamada H, Motomura T, Matsushita M, Fujiwara T, Maeda K, Handa K. “Prediction of Total Drug Clearance in Humans Using Animal Data: Proposal of a Multimodal Learning Method Based on Deep Learning” Journal of Pharmaceutical Sciences. 2021. Available from: https://doi.org/10.1016/j.xphs.2021.01.020

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Hiroaki Iwata, Naoto Kanda, Mitsugu Araki, Yukari Sagae, Katsuyoshi Masuda, Yasushi Okuno. “Discovery of Natural TRPA1 Activators through Pharmacophore-based Virtual Screening and a Biological Assay” Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters. 2020:127639. Available from: https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2020.127639

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Shuntaro Chiba, Aki Tanabe, Makoto Nakakido, Yasushi Okuno, Kouhei Tsumoto, Masateru Ohta. “Structure-based design and discovery of novel anti-tissue factor antibodies with cooperative double-point mutations, using interaction analysis” Sci Rep. 2020;10:17590. Available from: http://doi.org/10.1038/s41598-020-74545-4