原著論文Original Article

  • 99)

    Accurate prediction of complex structure and affinity for a flexible protein receptor and its inhibitor

    Bekker, G., Kamiya, N., Araki, M., Fukuda, I., Okuno, Y., Nakamura, H.

                                                                                                                        Chem. Theory Comput.

                                                                                                                      13(6), 2389–2399, 2017

  • 98)

    Clinical sequencing using a next-generation sequencing-based multiplex gene assay in patients with advanced solid tumors

    Kou, T., Kanai, M., Yamamoto, Y., Kamada, M., Nakatsui, M., Sakuma, T., Mochizuki, H., Hiroshima, A., Sugiyama, A., Nakamura, E., Miyake, H., Minamiguchi, S., Takaori, K., Matsumoto, S., Haga, H., Seno, H., Kosugi, S., Okuno, Y., Muto, M.

                                                                                                                                    Cancer Science

                                                                                                                                                 2017.

  • 97)

    Brigatinib combined with anti-EGFR antibody overcomes osimertinib resistance in EGFR-mutated non-small-cell lung cancer

    Uchibori, K., Inase, N., Araki, M., Kamada, M., Sato, S., Okuno, Y., Fujita, N., Katayama, R.

                                                                                                                     Nature Communications.

                                                                                                                                             8, 2017.

  • 96)

    CGBVS‐DNN: prediction of compound‐protein Interactions based on deep learning

    Hamanaka, M., Tanaishi, Kei., Iwata, H., Ye, J., Pei, J., Hou, J., Okuno, Y.,

                                                                                                                        Molecular Informatics.

                                                                                                                                    36(1-2), 2016

  • 95)

    The effect of conformational flexibility on binding free energy estimation between kinases and their Inhibitors

    Araki, M., Kamiya, N., Sato, M., Nakatsui, M., Hirokawa, T., Okuno, Y.,

                             Journal of Chemical Information and Modeling.

                                         56(12), 2445-2456, 2016.

  • 94)

    Association between UGT1A1*28*28 genotype and lung cancer in the Japanese population

    Nishikawa, Y., Kanai, M., Narahara, M., Tamon, A., Brown, J.B., Taneishi, K., Nakatsui, M., Okamoto, K., Uneno, Y., Yamaguchi, D., Tomono, T., Mori, Y., Matsumoto, S., Okuno, Y., Muto, M.,

                                              Int J Clin Oncol.

                                                   2016.

  • 93)

    Novel 5-fluorouracil-resistant human esophageal squamous cell carcinoma cells with dihydropyrimidine dehydrogenase overexpression

    Kikuchi, O., Ohashi, S., Nakai, Y., Nakagawa, S., Matsuoka, K., Kobunai, T., Takechi, T., Amanuma, Y., Yoshioka, M., Ida, T., Yamamoto, Y., Yasushi, Okuno.,Miyamoto, S., Nakagawa, H., Matsubara, K., Chiba, T., Muto, M.,

    Am. J. Cancer Res.
    5(8), 2431-2440, 2015.

  • 92)

    Antipsychotics-Associated Serious Adverse Events in Children: An Analysis of the FAERS Database.

    Goji, Kimura., Kaori, Kadoyama., J.B. Brown., Tsutomu, Nakamura., Ikuya, Miki., Kohshi Nisiguchi., Toshiyuki, Sakaeda., Yasushi, Okuno.,

    Int. J. Med. Sci.
    12(2),135-140, 2015

  • 91)

    Reliable preeclampsia pathways based on multiple independent microarray data sets

    Kawasaki, K., Kondoh, E., Chigusa, Y., Ujita, M., Murakami, R., Mogami, H.,Brown, J.B., Okuno, Y.Konishi, I.

    Molecular Human Reproduction
    21(2), 217-224,2015

  • 90)

    Two Novel ALK Mutations Mediate Acquired Resistance to the Next-Generation ALK Inhibitor Alectinib

    Katayama, R., Friboulet, L., Koike, S., Lockerman, E.L., Khan, T.M., Gainorl, J.F., Iafrate, A.J., Takeuchi, K., Taiji, M., Okuno, Y.,Fujita, N., Engelman, J.A., Shaw, A.T.,

    Clinical Cancer Research
    20(22),5686-5696,2014

総説Review etc.

著書Book

  • 胆と膵37 9月号  金井雅史, 高忠之, 松本繁巳, 武藤学, 児玉裕三, 増井俊彦, 高折恭一, 南口早智子, 鎌田真由美, 中津井雅彦, 奥野恭史, 佐久間朋寛, 望月洋明, 広島明宣 共著「網羅的癌関連遺伝子変異検査(OncoPrimeTM)による膵癌ゲノム異常解析と治療への応用」医学図書出版㈱ (2016)

  • 人工知能・機械学習・ディープラーニング関連技術とその活用  岩田浩明, 種石慶, 奥野恭史 共著「創薬と人工知能」 (株)情報機構 (2016)

  • 『人工知能・機械学習・ディープラーニング関連技術とその活用』

     岩田浩明, 種石慶, 奥野恭史 共著「創薬と人工知能」 (株)情報機構 (2016)

  • ビッグデータの収集、調査、分析と活用事例』 奥野恭史 共著 技術情報協会 (2014.11.28)

  • スーパーコンピュータ「京」によるビッグデータ創薬』 奥野恭史 共著「ビッグデータの収集、調査、分析と活用事例」 (株)技術情報協会 (2014)

  • 生命のビッグデータ利用の最前線』 奥野恭史 共著  シーエムシー出版 (2014)

  • 化学便覧 応用化学編 第7版』 奥野恭史 共著  丸善出版(株) (2014)

  • 疾患克服をめざしたケミカルバイオロジー(実験医学増刊)』 奥野恭史 共著   ㈱羊土社

  • シミュレーション辞典』 奥野恭史 共著  ㈱コロナ社 (2012)

  • 最新 創薬インフォマティクス活用マニュアル』 奥野恭史 編集  (株)メディカルドゥ  (2011)

  • Handbook of Systems Toxicology』 奥野恭史 共著  Wiley-Blackwell (2011)

  • 薬学の展望とロードマップ』 奥野恭史 共著  日本薬学会 (2010)

  • 医薬ジャーナル 増刊号 新薬展望2010』 奥野恭史 共著  ㈱医薬ジャーナル社  (2010)

  • 次世代創薬テクノロジー 実践:インシリコ創薬の最前線』 奥野恭史 共著  ㈱メディカル・ドゥ (2009)

  • コンピューターで薬を創ろう』 奥野恭史 共著  化学同人 (2009)

  • インシリコ創薬科学  -ゲノム情報から創薬へ-』 奥野恭史 共著・編集  京都廣川書店 (2008)

特許Patent

  • 特願2015-140912
    「イベント発生時期予測装置、イベント発生時期予測方法、及びイベント発生時期予測プログラム」

    発明者:奥野恭史, 武藤学, 松本繁巳, 金井雅史, 釆野優, 泰地真弘人, 種石慶

  • 特願2014-532989
    「化合物設計装置、化合物設計方法、及びコンピュータプログラム」

    発明者:奥野恭史, 金井千里

  • 特願2012-177572
    「ピぺラジン誘導体およびその用途」

    発明者:高須 清誠, 奥野恭史, 瀬木恵里, 原貴史, 山本佳宏,
    金井千里, 吉川達也, 閨正博, 河野晋哉

  • 特願2012-186072
    「化合物設計装置、化合物設計方法、及びコンピュータプログラム」

    発明者:奥野恭史, 金井千里, 吉川達也, 多門啓子

  • 特願2007-53322
    「マイクロRNA標的遺伝子予測装置」

    発明者:奥野恭史, 辻本豪三, 国本亮, 寺澤和哉,
    土屋創健, 秋山英雄, 妙本明

  • 特願2008-517917
    「ケミカルゲノム情報に基づく、タンパク質-化合物相互作用の予測と化合物ライブラリーの合理的設計」

    発明者:奥野恭史, 種石慶, 辻本豪三

  • 公開番号WO2007/139037 A1; PCT/JP2007/060736; 特願2006-147433
    「ケミカルゲノム情報に基づく、タンパク質-化合物相互作用の予測と化合物ライブラリーの合理的設計」

    発明者:奥野恭史, 種石慶, 辻本豪三

  • 公開番号WO2007/004479 A;特開2007-11752
    「データ処理装置、データ処理プログラム、それを格納したコンピュータ読み取り可能な記録媒体、およびデータ処理方法」

    発明者:奥野恭史, 種石慶, 辻本豪三, 梁 智允

  • 特願2005-192675
    「データ処理装置、データ処理プログラム、それを格納したコンピュータ読み取り可能な記録媒体、およびデータ処理方法」

    発明者:奥野恭史, 辻本豪三, 梁 智允, 種石 慶