教授プロフィールProfile

奥野 恭史

奥野 恭史 (おくの やすし)
Yasushi Okuno, Ph.D., Professor
近年、実験科学、理論科学とならぶ新たな潮流として、第三の科学である「シミュレーション科学」と第四の科学である「データ科学(data centric science)」が、世界的な注目をあびています。当研究室では、京大病院の実臨床データを用いた医療ビッグデータ解析・医療シミュレーションや、スーパーコンピュータ「京」を用いた創薬シミュレーション・ビッグデータ創薬の新たな方法論開発に取り組み、医療応用と創薬応用を目的としたシミュレーション科学とデータ科学の開拓を目指しています

 

 

研究・教育について

医療ビッグデータ解析・医療シミュレーション:
京大病院キャンサーバイオバンクプロジェクトにおいて収集されるがん患者の経時的臨床情報と生体試料に含まれる様々な生物学的情報を統合的に解析する新たな方法論を開発することで、データ主導型個別化医療と予測医療の実現を目指しています。具体的には、がん患者個人の病態変化・治療効果・副作用の予測、患者個人に最適な治療戦略の合理的推定、および新たなバイオマーカー・創薬ターゲットの探索等を行っています。

創薬シミュレーション・ビッグデータ創薬:
近年、製薬業界では、開発費を抑えながら効率的に新薬を開発することが重要課題の一つであり、計算機による創薬「インシリコ創薬」に大きな期待が寄せられています。とりわけ、世界最速レベルのスーパーコンピュータ「京」の利用が可能となり、創薬分野における計算科学・情報科学が開花期を迎えようとしています。当研究室は、製薬企業、IT企業、アカデミアの連携で産学コンソーシアムを設立し、スーパーコンピュータ「京」を用いた世界最先端の創薬計算技術の開発を行っています。

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実績紹介

平成 5年 3月
京都大学薬学部製薬化学科 卒業
平成 7年 3月
京都大学大学院薬学研究科修士課程薬品作用制御システム専攻 修了
平成 8年 4月
京都大学化学研究所・生体機能化学分野・教務職員
平成12年 9月
京都大学博士(薬学) 学位取得
平成13年 4月
京都大学化学研究所・バイオインフォマティクスセンター・博士研究員
平成14年10月
京都大学化学研究所・バイオインフォマティクスセンター・特任助手
平成15年11月
京都大学大学院薬学研究科・特任助手(COE)
平成17年12月
独立行政法人産業技術総合研究所・外来研究員(併任)
平成18年 4月
京都大学大学院薬学研究科・統合薬学フロンティア教育センター・統合薬学教育開発分野・准教授
平成19年 5月
独立行政法人医薬基盤研究所・トキシコゲノミクス・インフォマティクスプロジェクト・特別研究員(併任)
平成20年10月
京都大学大学院薬学研究科・寄附講座・システム創薬科学・教授
平成25年4月

先端医療振興財団 先端医療センター研究所 医薬品開発研究部 シミュレーション創薬グループ 客員グループリーダー(併任)

平成25年10月
京都大学大学院薬学研究科・統合薬学教育開発センター 薬学オープンイノベーション部門・教授
平成25年10月
独立行政法人理化学研究所 計算科学研究機構 研究部門 客員主管研究員(併任)
平成26年4月1日
京都大学大学院医学研究科 臨床システム腫瘍学 寄附講座 特定教授
平成26年10月
独立行政法人理化学研究所 生命システム研究センター 客員主管研究員(併任)
平成27年
先端医療振興財団 クラスター推進センター インシリコ創薬拠点形成推進グループ 部長(併任)
平成28年
理化学研究所 健康生き活き羅針盤リサーチコンプレックス推進プログラム 融合研究推進グループ 副グループディレクター(併任)
平成28年8月
京都大学大学院医学研究科 人間健康科学系専攻 教授(現職)
平成23年
日本化学療法学会会員
平成21年
日本バイオインフォマティクス学会 評議員
日本バイオインフォマティクス学会 関西部会部会長
平成19年
情報計算化学生物学会(CBI学会)会員
特定非営利活動法人 バイオグリッドセンター関西 会員
ケミカルバイロジー研究会会員
平成17年
日本バイオインフォマティクス学会バイオメディカル研究会運営委員
日本バイオインフォマティクス学会JSBi事典エディター
平成14年
日本分子生物学会会員
平成13年
日本バイオインフォマティクス学会会員
平成 5年
日本薬学会会員
 
 
平成23年
最先端・次世代研究開発支援プログラム
「新薬創出を加速化するインシリコ創薬基盤の確立」(代表)
平成22年
(独)武田科学振興財団・2010年度薬学系研究奨励継続助成
「ケミカルゲノミクスに基づく超多次元構造活性相関解析法の開発」(代表)
平成22年
(独)科学技術振興機構(JST) 研究成果最適展開事業 A-STEP 本格研究開発ステージ実用化挑戦タイプ(中小・ベンチャー開発)
「医薬品リード創製・最適化システム」
平成22年
文部科学省・科学研究費補助金 新学術領域研究(研究領域提案型)
「小分子-生体システム相互作用の分子階層における統合的解析」(代表)
平成22年
厚生労働省・厚生労働科学研究費補助金(化学物質リスク研究事業)
「新規な化学物質の安全性を予測・評価する新規計算手法の開発」(代表)
平成22年
文部科学省・科学研究費補助金 若手研究(A)
「ケミカルゲノミクスに基づく創薬インフォマティクスの開拓」(代表)
平成22年
(独)日本学術振興会・科学研究費補助金 研究成果公開促進費(データベース)
「Gタンパク質共役型受容体-リガンド相互作用データベース」(代表)
平成21年
平成21年ものづくり中小企業製品開発等支援補助金(実証等支援事業)全国中小企業団体中央会
「新規インシリコスクリーニング手法を搭載した医薬品候補化合物探索システムの性能評価」(代表)
平成21年
企業研究者活用型基礎研究推進事業 (独)科学技術振興機構(JST)
「創薬を加速する医薬品候補化合物の選択性予測システムの開発」(代表)
平成21年
平成21年度京都大学若手研究者ステップアップ研究費
「多重標的ドラッグデザインを指向した新規創薬理論の構築」(代表)
平成21-22年
文部科学省・科学研究費補助金 挑戦的萌芽研究
『次世代型創薬「ネットワーク創薬」の創成』(代表)
平成21年
(独)日本学術振興会・科学研究費補助金・研究成果公開促進費「データベース」
「Gタンパク質共役型受容体―リガンド相互作用データベース」(代表)
平成20-22年
(独)情報通信研究機構 平成20年度民間基盤技術研究促進制度(NICT)
「パターン認識アルゴリズムに基づく高精度な創薬シード・リード化合物探索手法のシステム開発」(代表)
平成20-24年
(独)新エネルギー・産業技術総合開発機構 産業技術研究助成事業費(若手研究グラント)
「ケミカルゲノミクス情報に基づく高性能なインシリコ創薬システムの研究開発」(代表)
平成20年
(独)武田科学振興財団・2008年度薬学系研究奨励
「ケミカルゲノミクスに基づく超多次元構造活性相関解析法の開発」(代表)
平成20年
第8回バイオビジネスコンペJAPAN
「ケミカルゲノミクス情報に基づく高精度なインシリコ創薬システムの開発と事業展開」
平成20年
(独)日本学術振興会・科学研究費補助金・研究成果公開促進費「データベース」
「Gタンパク質共役型受容体−リガンド相互作用データベース」(代表)
平成19-23年

文部科学省・ターゲットタンパク研究プログラム
「化合物ライブラリーの基盤構築とタンパク質制御技術の開発」(代表:藤井信孝)

平成19-23年
(独)日本学術振興会・科学研究費補助金・基盤研究(S)
「包括的トランスクリプトームによる新たなゲノム医学、創薬研究」(代表:辻本豪三)
平成19年
経済産業省(近畿経済産業局)・平成19年度地域新生コンソーシアム研究開発事業
「インシリコ技術の活用によるH-PGDS活性阻害化合物の開発」(代表:(財)千里国際情報事業財団)
平成19年
(独)科学技術振興機構・重点地域研究開発推進プログラム(シーズ発掘試験)
「高効率なインシリコ薬物探索システムの研究開発」(代表)
平成19年
(独)日本学術振興会・科学研究費補助金・研究成果公開促進費「データベース」
「Gタンパク質共役型受容体−リガンド相互作用データベース」(代表)
平成19年
(株)積水インテグレーテッドリサーチ・第6回(2007年度)積水化学自然に学ぶものづくり研究助成プログラム
「ケミカルゲノミクスの分子間相互作用解析に学ぶ新規分子設計手法の開発」(代表)
平成19年
(財)立石科学技術振興財団・平成19年度研究助成
「機械学習に基づく創薬支援システムの開発」(代表)
平成18-22年
(独)医薬基盤研究所・保健医療分野における基礎研究推進事業
「HGF-Met受容体系を標的とするインシリコ分子創薬研究」(代表:松本邦夫)
平成18-20年
(財)サントリー生物有機科学研究所・研究助成金(SUNBOR GRANT)
「ケミカルゲノミクスのためのIn silico支援システムの開発」(代表)
平成18-19年
文部科学省・科学研究費補助金・若手研究(B)
「ケミカルゲノミクスのためのパスウェイ解析法の開発」(代表)
平成18-19年
文部科学省・科学研究費補助金・特定領域研究
「微量臨床検体発現プロファイルによるがんの個別化治療」(代表:辻本豪三)
平成18年
厚生労働省・科学研究費補助金、医療安全・医療技術評価総合研究事業
「テキストマイニングによる薬物有害事象の自動抽出を目的としたオントロジー構築とシステム開発」(代表:金子周司)
平成18年
(独)日本学術振興会・科学研究費補助金・研究成果公開促進費「データベース」
「Gタンパク質共役型受容体―リガンド相互作用データベース」(代表)
平成18年
(財)大川情報通信基金・2006年度研究助成
「ケミカルバイオ情報に基づく生体ネットワーク解析法の開発」(代表)
平成17-19年
厚生労働科学研究費・萌芽的先端医療技術推進研究推進事業(トキシコゲノミクス分野)
「トキシコゲノミクスのための遺伝子ネットワーク解析法の開発」(代表)
平成17-21年
経済産業省・機能性RNAプロジェクト
「機能性RNA解析に基づくゲノム医学研究」(分担<代表:東レ(株)>)
平成17-18年
科学研究費補助金・基盤研究(A)
「ゲノム情報に基づく新規遊離脂肪酸受容体群のリガンド同定と機能解析」(代表:辻本豪三)
平成17-18年
科学研究費補助金・萌芽研究
「未知ゲノム配列non-codingRNAの機能解析」(代表:辻本豪三)
平成16-17年
科学研究費補助金・若手研究(B)
「メタボロームの網羅的解析に向けた代謝ネットワーク予測システムの開発」(代表)
平成16年
科学研究費補助金・特定領域研究(2)
「ゲノム情報と化学情報の融合に向けたケミカルゲノムネットワークの構築」(代表)
平成12年
科学研究費補助金・奨励研究(A)
「高次複合体系における蛋白質-蛋白質-DNA相互作用ネットワークの動的構造解析」(代表)
平成10-11年
科学研究費補助金・奨励研究(A)
「遺伝子疾患を標的とした新機能アロステリックリボザイムの新創製と機能解析」(代表)
平成 8年
京都大学学術研究奨励金
「遺伝子疾患を標的とした新機能医薬の創製(ゲノムドラッグデザイン)に関する研究」(代表)
平成 8年
(財)医薬資源研究振興会・研究奨励金
「遺伝子疾患を標的とした新機能ゲノム医薬の創製に関する研究」(代表)