• Department of Biomedical Data Intelligence,
    Graduate School of Medicine, Kyoto University

    当研究室では、京大病院の実臨床データを用いた医療ビッグデータ解析・医療シミュレーションや、スーパーコンピュータ「富岳」を用いた創薬シミュレーション・ビッグデータ創薬の新たな方法論開発に取り組み、医療応用と創薬応用を目的としたシミュレーション科学とデータ科学の開拓を目指しています。

Drug discovery創薬

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Medical医療

新着情報

  • 2025.03.07 報道

    当ラボの研究が京都大学ホームページで紹介されました。
    弘前大学および富士通株式会社と、複数データを統合することで少量データでも高精度に因果関係を導出するAI技術を開発しました

  • 2025.03.07 インフォメーション

    奥野教授が講演します。
    第36回 製薬協政策セミナー 日本の創薬力向上を目指して
    講演3「日本の創薬とDX」

    ■日 時:2025年3月17日(月)13:00~16:00
    ■形 式:会場 & オンライン ハイブリッド開催
    ■会 場:室町三井ホール&カンファレンス(東京都中央区日本橋室町3-2-1 CORED室町テラス 3階
    ■受講費:無料
    ■定 員:【会場】120名
    ■主 催:日本製薬工業協会
    ■共 催:日本経済新聞社
    ■お申し込み参加フォーム ※締切り:【会場聴講】3月9日(日)【オンライン聴講】3月16日(日)
    ■お問い合わせ:製薬協政策セミナー事務局
            https://conf1.nep-sec.jp/form/bfb6wP

  • 2025.02.25 論文

    Cozac R, Hasic H, Choong JJ, Richard V, Beheshti L, Froehlich C, Koyama T, Matsumoto S, Kojima R, Iwata H, Hasegawa A, Otsuka T, Okuno Y, kMoL: an open-source machine and federated learning library for drug discovery, Journal of Cheminformatics, 17(1):22, 2025/2/25 , doi:10.1186/s13321-025-00967-9

  • 2025.02.21 講演

    奥野教授が講演しました。
    立命館大学 創剤・製剤技術研究コンソーシアム 2024年度第2回研究会
    2025/2/21 立命館大学 大阪いばらきキャンパス
    「DXで目指す創薬イノベーション」

  • 2025.02.06 論文

    Fujita A, Goto K, Ueda A, Kuroda Y, Kawai T, Okuzu Y, Okuno Y, Matsuda S. Measurement of the Acetabular Cup Orientation After Total Hip Arthroplasty Based on 3-Dimensional Reconstruction From a Single X-Ray Image Using Generative Adversarial Networks, The Journal of Arthroplasty, 40(1):136-143.e1., 2025/1, doi:10.1016/j.arth.2024.06.059

  • 2025.01.23 講演

    大田雅照 上級研究員が講演しました。
    The 7th R-CCS International Symposium
    2025/1/23 KOBE International Conference Center, Reception Hall
    「AI-Powered Transformation of Simulations in Drug Discovery」

  • 2025.01.23 学会発表

    奥野Gメンバーが学会でポスター発表を行いました。

    S Chiba, T Yamane, M Ikeguchi, M Ohta, 
    “Parallel Bayesian Optimization of Atomic-Level Interaction Descriptors for Protein Modeling”
    The 7th R-CCS International Symposium, 2025/1/23, KOBE International Conference Center

  • 2025.01.22 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    峰晴陽平, 奥野恭史, 
    シンポジウム
    「AIによる過去・現在・未来の可視化がもたらすヘルスケア・医療イノベーション」
    第2回 Medical Innovation Centerで拓く未来医療のためのデジタルイノベーション, 2025/1/22,

    京都大学メディカルイノベーションセンター 1階セミナー室開催およびZoom配信(ハイブリッド開催)

  • 2025.01.07 執筆

    奧野Gメンバーの執筆が掲載されました。
    山崎公裕, 和田裕一郎, 和田睦世, 河東孝, 德久淳師, 奥野恭史,「CryoEM画像群から多様な分子構造変化を予測する生成A I」, 「Medical Science Digest」2025年1月号, p12-15(2025年1月発行)

  • 2024.12.27 論文

    Taisei Tosaki, Eiichiro Uchino, Yohei Harada, Minoru Sakuragi, Yusuke Koyanagi, Seiji Okajima, Hirofumi Suzuki, Kentaro Kanamori, Masahiro Asaoka, Kouji Kurihara, Takuya Takagi, Koji Maruhashi, Yoshinori Tamada, Tatsuya Mikami, Koichi Murashita, Shigeyuki Nakaji, Yasushi Okuno, Subgrouping Causal Networks of Disease Onset in Large-scale Health and Medical Data using Supercomputer Fugaku., 2024 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), Lisbon, Portugal, pp.4384-4391, 2024, doi:10.1109/BIBM62325.2024.10822105

  • 2025.02.25 論文

    Cozac R, Hasic H, Choong JJ, Richard V, Beheshti L, Froehlich C, Koyama T, Matsumoto S, Kojima R, Iwata H, Hasegawa A, Otsuka T, Okuno Y, kMoL: an open-source machine and federated learning library for drug discovery, Journal of Cheminformatics, 17(1):22, 2025/2/25 , doi:10.1186/s13321-025-00967-9

  • 2025.02.06 論文

    Fujita A, Goto K, Ueda A, Kuroda Y, Kawai T, Okuzu Y, Okuno Y, Matsuda S. Measurement of the Acetabular Cup Orientation After Total Hip Arthroplasty Based on 3-Dimensional Reconstruction From a Single X-Ray Image Using Generative Adversarial Networks, The Journal of Arthroplasty, 40(1):136-143.e1., 2025/1, doi:10.1016/j.arth.2024.06.059

  • 2024.12.27 論文

    Taisei Tosaki, Eiichiro Uchino, Yohei Harada, Minoru Sakuragi, Yusuke Koyanagi, Seiji Okajima, Hirofumi Suzuki, Kentaro Kanamori, Masahiro Asaoka, Kouji Kurihara, Takuya Takagi, Koji Maruhashi, Yoshinori Tamada, Tatsuya Mikami, Koichi Murashita, Shigeyuki Nakaji, Yasushi Okuno, Subgrouping Causal Networks of Disease Onset in Large-scale Health and Medical Data using Supercomputer Fugaku., 2024 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), Lisbon, Portugal, pp.4384-4391, 2024, doi:10.1109/BIBM62325.2024.10822105

  • 2024.12.25 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Park Y, Matsumoto S, Ogata K, Ma B, Kanada R, Isaka Y, Arichi N, Liang X, Maki R, Kozasa T, Okuno Y, Ohno H, Ishihama Y, Toyoshima F, Receptor-independent regulation of Gα13 by alpha-1-antitrypsin C-terminal peptides, Journal of Biological Chemistry, 301(2):108136, 2024/12/25, doi:10.1016/j.jbc.2024.108136

  • 2024.11.22 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Igarashi Y, Hasegawa A, Matsumoto S, Iwata H, Kojima R, Okuno Y, Yamada H, Constructing a graph neural network-based artificial intelligence model to predict drug-induced phospholipidosis potential, Fundamental Toxicological Sciences, 11(6):279-288, 2024/11/22, doi:10.2131/fts.11.279

  • 2024.11.11 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Toda Y, Fujita H, Mino K, Koyama T, Matsuoka S, Kaizuka T, Agawa M, Matsumoto S, Idei A, Nishikori M, Okuno Y, Osada H, Yoshida M, Takaori-Kondo A, Iwai K, Synergistic involvement of the NZF domains of the LUBAC accessory subunits HOIL-1L and SHARPIN in the regulation of LUBAC function, Cell Death & Disease, 15(11):813, 2024/11/11, doi:10.1038/s41419-024-07199-z

  • 2024.11.11 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Sasagasako T, Ueda A, Mineharu Y, Mochizuki Y, Doi S, Park S, Terada Y, Sano N, Tanji M, Arakawa Y, Okuno Y, Postoperative Karnofsky performance status prediction in patients with IDH wild-type glioblastoma: A multimodal approach integrating clinical and deep imaging features, PLoS One, 11;19(11):e0303002, 2024/11/11, doi:10.1371/journal.pone.0303002

  • 2024.10.22 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Yamaji K, Kanenawa K, Morofuji T, Nishikawa R, Imada K, Kohjitani H, Watanabe H, Tazaki J, Taniwaki M, Koga S, Akashi R, Kubo S, Ohya M, Kikuchi T, Ohira H, Numasawa Y, Arikawa M, Iwama M, Kitai T, Kobayashi Y, Shiomi H, Tada T, Yamaji Y, Daidoji H, Ohtani H, Furukawa Y, Kadota K, Toyofuku M, Ando K, Ono K, Kimura T; PREDICTOR investigators, Serial Optical Coherence Tomography Assessment of Coronary Atherosclerosis and Long-Term Clinical Outcomes., J Am Heart Assoc., 13(21):e034458, 2024/10/22, doi:10.1161/JAHA.123.034458

  • 2024.10.12 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Mitsugu A, Toru E, Kazuhiro T, Shigeyuki M, Yunoshin T, Hironori K, Gert-Jan B, Tsutomu Y, Yuta I, Yukari S, Narutoshi K, Mitsunori I, Yasushi O, Molecular Dynamics Unveils Multiple-Site Binding of Inhibitors with Reduced Activity on the Surface of Dihydrofolate Reductase, Journal of the American Chemical Society, 2024/10/12, In press, doi:10.1021/jacs.4c04648

  • 2024.08.27 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Tomoki S, Yohei M, Takeshi F, Yasutaka F, Hideo C, Silsu P, Kota N, Yasuzumi M, Masakazu O, Takayuki K, Yoshiki A, RNF213 Mutation Associated with the Progression from Middle Cerebral Artery Steno-Occlusive Disease to Moyamoya Disease, Translational stroke research, Advance online publication, 2024/8/27, doi:10.1007/s12975-024-01293-2

  • 2025.02.21 講演

    奥野教授が講演しました。
    立命館大学 創剤・製剤技術研究コンソーシアム 2024年度第2回研究会
    2025/2/21 立命館大学 大阪いばらきキャンパス
    「DXで目指す創薬イノベーション」

  • 2025.01.23 講演

    大田雅照 上級研究員が講演しました。
    The 7th R-CCS International Symposium
    2025/1/23 KOBE International Conference Center, Reception Hall
    「AI-Powered Transformation of Simulations in Drug Discovery」

  • 2024.12.14 講演

    糀谷泰彦 特定助教が講演しました。
    第16回 KCGH Forum
    2024/12/14 三宮研修センター(神戸)
    招待講演「深層学習を中心とした循環器AI研究・社会実装の現状と展望」

  • 2024.12.13 講演

    糀谷泰彦 特定助教が講演しました。
    KYOTO Cardiovascular Meeting会
    2024/12/13 オンライン開催
    招待講演「深層学習を中心とした循環器AI研究・社会実装の現状と展望」

  • 2024.12.07 講演

    糀谷泰彦 特定助教が講演しました。
    日本生体医工学会関西支部 第108回BioMecForum21 講演会
    2024/12/7 滋賀医科⼤学およびオンライン(ハイブリッド開催)
    招待講演「iPS細胞由来心筋細胞のin-silico:そのニーズと発展性」

  • 2024.11.27 講演

    戸崎泰誠さんが講演しました。
    京都大学基金感謝の集い2024
    2024/11/27 京都大学百周年時計台記念館
    「医療AIで目指す未来」

  • 2024.11.15 講演

    奥野教授が滋賀医科大学にて講義を行いました。
    滋賀医科大学医学部医学科「医学特論」
    2024/11/15 滋賀医科大学 臨床講義棟
    「ビッグデータ・AI医療が拓く医療の未来」

  • 2024.11.02 講演

    奥野教授が講演しました。
    第32回日本消化器関連学会(JDDW 2024)
    2024/11/2 神戸国際会議場 第13会場
    医療セミナー「生成AIで変わる診療・研究・教育」
    「AI・シミュレーションによる創薬DX」

  • 2024.10.30 講演

    奥野教授をはじめ当研究室の先生方が講演しました。
    CBI学会2024年大会
    2024/10/30 タワーホール船堀
    スポンサードセッション「LINCが目指す創薬DXプラットフォーム」
    「創薬DXプラットフォームの概要と進捗」 奥野 恭史((一社)ライフ インテリジェンス コンソーシアム)
    「ベイジアンネットにより標的分子探索」  玉田 嘉紀(弘前大学大学院 医学研究科)
    「HPCによる超大量ドッキングとAIによる巨大空間の探索」 大田 雅照(理化学研究所 計算科学研究センター)
    「化合物生成AIのアルゴリズム」 寺山 慧(横浜市立大学大学院 生命医科学研究科)
    「Federated Learningの紹介」 小島 諒介(京都大学大学院 医学研究科)

  • 2024.10.26 講演

    奥野教授が講演しました。
    第62回日本癌治療学会学術集会
    2024/10/26 福岡国際会議場
    会長企画 教育シンポジウム2「医学・医療における生成AIの可能性と課題」
    「生成AIは創薬を変革できるのか」

  • 2025.01.23 学会発表

    奥野Gメンバーが学会でポスター発表を行いました。

    S Chiba, T Yamane, M Ikeguchi, M Ohta, 
    “Parallel Bayesian Optimization of Atomic-Level Interaction Descriptors for Protein Modeling”
    The 7th R-CCS International Symposium, 2025/1/23, KOBE International Conference Center

  • 2025.01.22 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    峰晴陽平, 奥野恭史, 
    シンポジウム
    「AIによる過去・現在・未来の可視化がもたらすヘルスケア・医療イノベーション」
    第2回 Medical Innovation Centerで拓く未来医療のためのデジタルイノベーション, 2025/1/22,

    京都大学メディカルイノベーションセンター 1階セミナー室開催およびZoom配信(ハイブリッド開催)

  • 2024.12.18 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    小山 拓豊, 津村 颯人, 沖田 龍之介, 山崎 公裕, 河東 孝, 長谷川 亜樹, 岩田 浩明, 小島 諒介, 松本 篤幸, 奥野 恭史, 
    「ケミカルゲノミクス言語モデルを用いた化合物-タンパク質間相互作用の大規模予測」
    第47回ケモインフォマティクス討論会, 2024/12/18, 金沢商工会議所会館

  • 2024.12.13 学会発表

    奥野Gメンバーが学会でポスター発表を行いました。

    A Kikuchi, T Ekimoto, T Yamane, S Chiba, K Shimizu, S Fujii, M Ikeguchi, 
    “Antigen recognition by predicting the three-dimensional structure of killer T cell-derived T cell receptors”
    第52回構造活性相関シンポジウム, 2024/12/12-13, 川崎市産業振興会館

  • 2024.12.13 学会発表

    奥野Gメンバーが学会でポスター発表を行いました。

    千葉峻太朗, 邦武克彦, 青木吉嗣, 横田俊文, 奥野恭史, 
    「エクソンスキッピングのためのアンチセンス核酸オリゴマーデータベースとスキップ効率予測」
    第52回構造活性相関シンポジウム, 2024/12/12-13, 川崎市産業振興会館

  • 2024.12.13 学会発表

    奥野Gメンバーが学会でポスター発表を行いました。

    山根努, 大田雅照, 池口満徳, 
    「2次元レプリカ交換シミュレーションによる環状ヘキサペプチドの膜透過過程の解析」
    第52回構造活性相関シンポジウム, 2024/12/12-13, 川崎市産業振興会館

  • 2024.12.07 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    Yohei Mineharu, Yuki Oichi, Tohru Tezuka, Miki Yoshioka, Kuan-Chun Lan, Wataru Fujibuchi, Harunobu Kagawa, Tomoko Matsumoto, Satoshi Ueha, Shigeyuki Shichino, Maria Jose Lopez Iniesta, Silsu Park, Yoshiki Arakawa, Akio Koizumi, Susumu Miyamoto, Makoto Ikeya, Knut Woltjen, Jun K Yamashita, Shohab Youssefian, 
    “Correcting RNF213 mutations in iPS cells uncovers gene dysregulation contributing to partial EndMT in moyamoya disease”
    CVMW (Cardiovascular metabolism week) 2024, 2024/12/7, ステーションコンファレンス東京

  • 2024.12.06 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    Taisei Tosaki, Eiichiro Uchino, Yohei Harada, Minoru Sakuragi, Yusuke Koyanagi, Seiji Okajima, Hirofumi Suzuki, Kentaro Kanamori, Masahiro Asaoka, Kouji Kurihara, Takuya Takagi, Koji Maruhashi, Yoshinori Tamada, Tatsuya Mikami, Koichi Murashita, Shigeyuki Nakaji, Yasushi Okuno, 
    “Subgrouping Causal Networks of Disease Onset in Large-scale Health and Medical Data using Supercomputer Fugaku.”
    IEEE BIBM 2024 International Workshop on Foundations of Network Analysis, 2024/12/3-6, Lisbon, Portgual

  • 2024.11.25 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    千葉峻太朗, 小湊みのり, 邦武克彦, 青木吉嗣, 横田俊文, 奥野恭史, 
    「エクソンスキッピングのためのアンチセンス核酸オリゴマーデータベースおよびスキップ効率予測」
    2024年度疾患モデルを駆使した筋ジストロフィーの治療法開発研究班会議, 2024/11/25, NCNP教育研修棟(東京)

  • 2024.11.16 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    峰晴陽平, 笹ヶ迫知紀, 植田彰彦, 丹治正大, 佐野徳隆, 高田茂樹, 山本悦子, 牧野恭秀, 荒川芳輝, 奥野恭史, 
    「膠芽腫の術前後のMRI画像情報は機械学習によるKPS推移予測に寄与する」
    第12回Neuro-Oncology WEST, 2024/11/16, 大阪