• Department of Biomedical Data Intelligence,
    Graduate School of Medicine, Kyoto University

    当研究室では、京大病院の実臨床データを用いた医療ビッグデータ解析・医療シミュレーションや、スーパーコンピュータ「富岳」を用いた創薬シミュレーション・ビッグデータ創薬の新たな方法論開発に取り組み、医療応用と創薬応用を目的としたシミュレーション科学とデータ科学の開拓を目指しています。

Drug discovery創薬

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Medical医療

新着情報

  • 2026.03.12 講演

    奥野教授がご講演されました。
    是非ご参加ください。
    立命館大学薬学部シンポジウム「データサイエンスと薬学」
    招待講演「AI/DX駆動型創薬の未来」

    ■日 時:2026年3月12日(木)13:00~18:00
    ■形 式:対面/オンライン ハイブリッド開催
    ■会 場:立命館大学 びわこくさつキャンパス(BKC) ローム記念館 5F 大会議室
    ■参加費:無料
    ■主 催:立命館大学 薬学部
    ■お申し込み参加フォーム
    ■お問い合わせ:立命館大学薬学部
            E-mail:yak-conc@st.ritsumei.ac.jp

  • 2026.02.25 学会発表

    奥野Gメンバーが学会でポスター発表を行いました。

    Minoru Sakuragi, Tomomi Endo, Eri Muso, Takeshi Matsubara, & Tatsuo Tsukamoto.
    Effectiveness and safety of cyclophosphamide in induction therapy for elderly patients with microscopic polyangiitis and renal impairment: A 32-case series, IVW 2026, 2026/2/21-25, Melbourne, Australia

  • 2026.02.09 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    Minoru Sakuragi, Yasushi Okuno,”AI platform to accelerate drug discovery—Drug Discovery DX Platform”, Quantum Computing and Drug Discovery Symposium, 2026/2/9, IBM Research Lab, Cambridge, MA, USA

  • 2026.02.02 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました。 

    Sakuragi M, Miyauchi M, Kubo M, Aso M, Ogura S, Sokai Y, Tsuji Y, Mori KP, Torikoshi K, Suzuki H, Komiya T, Muso E, Endo T, Matsubara T, Tsukamoto T, Plasma Exchange for Anti-GBM Disease With Dialysis Dependency: A Case Series on Clinical Outcomes and Safety, Ther Apher Dial., 2026/2/2, Epub ahead of print., doi:10.1002/1744-9987.70121

  • 2026.01.30 講演

    奥野教授がご講演されました。
    令和7年度先導的学際研究機構創薬サイエンス部門シンポジウム
    基調講演「AIは創薬を変革できるか」

    ■日 時:2026年1月30日(金)13:00~16:00
    ■形 式:会場 & オンライン ハイブリッド開催
    ■会 場:大阪大学コンベンションセンター2階会議室3
    ■参加費:無料
    ■主 催:大阪大学先導的学際研究機構 創薬サイエンス部門
    ■後 催:国立研究開発法人日本医療研究開発機構(AMED)/日本製薬工業協会(製薬協)
    ■お申し込み参加フォーム
    ■お問い合わせ:大阪大学先導的学際研究機構 創薬サイエンス部門事務局 竹市 未帆
            E-mail:takeichi@phs.osaka-u.ac.jp

  • 2026.01.30 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Koyama T, Tsumura H, Okita R, Yamazaki K, Hasegawa A, Imamura K, Kato T, Iwata H, Kojima R, Inoue H, Matsumoto S, Okuno Y, Chemical genomics language model toward reliable and explainable compound-protein interaction exploration, J Cheminform, 2026/1/30, Epub ahead of print., doi:10.1186/s13321-026-01155-z

  • 2026.01.27 学会発表

    奥野Gメンバーが学会でポスター発表を行いました。

    S Chiba, K Kunitake, Y Aoki, T Yokota, Y Okuno,                                                            Prediction of exon-skipping antisense oligonucleotide activity through a genome foundation model”                                    SCA/HPCAsia 2026, 2026/1/27, Osaka International Convention Center, Osaka, Japan

  • 2026.01.10 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Koyama T, Iwata H, Kojima R, Otsuka T, Hasegawa A, Lee S, Ueda H, Morimoto T, Sasaki R, Torimoto N, Murakami S, Tojo M, Honma T, Matsumoto S, Okuno Y, Empowering federated learning for robust compound-protein interaction prediction across heterogeneous cross-pharma domains, J Cheminform, 18(1):16, 2026/1/10, doi:10.1186/s13321-025-01147-5

  • 2026.01.03 執筆

    奥野教授が企画立案された医学雑誌が発行されました。

    奥野教授および奧野Gメンバーの執筆が掲載されております。
    ・奥野恭史, 序文「はじめに」, p1

    ・内野詠一郎,「疾患発症予防とAI─個別化介入に向けた現在地と展望」, p3-7
    ・櫻木 実,「臨床データ起点の創薬標的探索─AIによるデータ駆動型アプローチ」, p21-26
    ・松本篤幸, 小山拓豊,「創薬DX実現に向けた低分子創薬AIの進展と展望」, p40-45
    ・千葉峻太郎,「核酸医薬のためのアンチセンス核酸のデータベースと活性予測技術」, p52-56
    ・小島諒介,「創薬計算技術 創薬のための分子深層学習ツールと基盤モデル」, p75-79

    ・荒木望嗣,「創薬計算技術 分子シミュレーション」, p90-95
    ・大塚教雄,「AIとシミュレーション技術に基づく創薬DXプラットフォームの開発」, p102-108
    医学のあゆみ』296巻1号「AI×ビッグデータが実現する創薬DX」
    (2026年1月発行)

  • 2025.12.31 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Shunsuke Takayanagi, Keita P. Mori, Youngna Kang, Mitsugu Araki, Shigeyuki Matsumoto, Yukari Sagae, Nana Sakakibara, Tomoko Horinouchi, Yoshiaki Higashi, Tomomi Endo, Eri Muso, Kandai Nozu, Yasushi Okuno, Motoko Yanagita, Takeshi Matsubara, and Tatsuo Tsukamoto, Functional analysis of a novel pathogenic glycine amidinotransferase mutant in hereditary Fanconi syndrome, Kidney Medicine, 2025, (In press)

  • 2026.02.02 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました。 

    Sakuragi M, Miyauchi M, Kubo M, Aso M, Ogura S, Sokai Y, Tsuji Y, Mori KP, Torikoshi K, Suzuki H, Komiya T, Muso E, Endo T, Matsubara T, Tsukamoto T, Plasma Exchange for Anti-GBM Disease With Dialysis Dependency: A Case Series on Clinical Outcomes and Safety, Ther Apher Dial., 2026/2/2, Epub ahead of print., doi:10.1002/1744-9987.70121

  • 2026.01.30 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Koyama T, Tsumura H, Okita R, Yamazaki K, Hasegawa A, Imamura K, Kato T, Iwata H, Kojima R, Inoue H, Matsumoto S, Okuno Y, Chemical genomics language model toward reliable and explainable compound-protein interaction exploration, J Cheminform, 2026/1/30, Epub ahead of print., doi:10.1186/s13321-026-01155-z

  • 2026.01.10 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Koyama T, Iwata H, Kojima R, Otsuka T, Hasegawa A, Lee S, Ueda H, Morimoto T, Sasaki R, Torimoto N, Murakami S, Tojo M, Honma T, Matsumoto S, Okuno Y, Empowering federated learning for robust compound-protein interaction prediction across heterogeneous cross-pharma domains, J Cheminform, 18(1):16, 2026/1/10, doi:10.1186/s13321-025-01147-5

  • 2025.12.31 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Shunsuke Takayanagi, Keita P. Mori, Youngna Kang, Mitsugu Araki, Shigeyuki Matsumoto, Yukari Sagae, Nana Sakakibara, Tomoko Horinouchi, Yoshiaki Higashi, Tomomi Endo, Eri Muso, Kandai Nozu, Yasushi Okuno, Motoko Yanagita, Takeshi Matsubara, and Tatsuo Tsukamoto, Functional analysis of a novel pathogenic glycine amidinotransferase mutant in hereditary Fanconi syndrome, Kidney Medicine, 2025, (In press)

  • 2025.12.29 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Seungeon Lee, Takuto Koyama, Itsuki Maeda, Shigeyuki Matsumoto, Yasushi Okuno, HELM-BERT: A Transformer for Medium-Sized Peptide Property Prediction, arXiv:2512.23175, 2025/12/29, https://arxiv.org/abs/2512.23175

  • 2025.12.24 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Fukushima Y, Wang Y, Yada-Makino Y, Komuro H, Demachi-Okamura A, Sugita Y, Okamoto T, Ishihara H, Mizuta R, Sun Y, Matsui T, Araki M, Biao M, Okuno Y, Masago K, Yamaguchi R, Guo Z, Onoguchi K, Yamashita Y, Fukuyama T, Nabekura T, Matsushita H, Iwata H, Muraoka D, Functional and structural analysis of KK-LC-1-specific T cell receptors from patients with lung Cancer for immunotherapy, Cell Immunol, 419:105059, 2025/12/24,  Epub ahead of print., doi:10.1016/j.cellimm.2025.105059

  • 2025.11.27 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Bekker GJ, Araki M, Oshima K, Okuno Y, Kamiya N, Molecular recognition of natural compounds by MR1 and their implication in MAIT cell activation elucidated through McMD-based dynamic docking simulations, Sci Rep., 15(1):45487, 2025/11/27, doi:10.1038/s41598-025-28682-3

  • 2025.11.10 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Ito S*, Koyama, T*, Matsumoto S, Kojima R, Okamoto Y, Kuroda M, Kawashima H, Watanabe R, Yonezawa T, Sumiyoshi T, Ikeda K, Mizuguchi K, Iwata H, Okuno Y, Improving ADME Prediction with Multitask Graph Neural Networks and Assessing Explainability in Lead Optimization, J Chem Inf Model, 65(21):11796-11803, 2025/11/10, Epub 2025 Oct 22, doi:10.1021/acs.jcim.5c00758

  • 2025.11.10 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Yuji Okamoto, Transformers for Time-Series Forecasting: A Comprehensive Survey through 2024, NOLTA, E17-N(1), 2026/1, (In press)

  • 2025.11.06 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Toshiaki Katayama, Shuichi Kawashima, Yuki Moriya, Ryosuke Kojima, Takuto Koyama, Mayumi Kamada, Accelerating Drug Discovery through Semantic Data Integration and Machine Learning: From Biomedical Knowledge Graphs to Predictive Models, ISWC 2025 Companion Volume(Poster Presentation), 2025/11/2-6

  • 2026.03.12 講演

    奥野教授がご講演されました。
    是非ご参加ください。
    立命館大学薬学部シンポジウム「データサイエンスと薬学」
    招待講演「AI/DX駆動型創薬の未来」

    ■日 時:2026年3月12日(木)13:00~18:00
    ■形 式:対面/オンライン ハイブリッド開催
    ■会 場:立命館大学 びわこくさつキャンパス(BKC) ローム記念館 5F 大会議室
    ■参加費:無料
    ■主 催:立命館大学 薬学部
    ■お申し込み参加フォーム
    ■お問い合わせ:立命館大学薬学部
            E-mail:yak-conc@st.ritsumei.ac.jp

  • 2026.01.30 講演

    奥野教授がご講演されました。
    令和7年度先導的学際研究機構創薬サイエンス部門シンポジウム
    基調講演「AIは創薬を変革できるか」

    ■日 時:2026年1月30日(金)13:00~16:00
    ■形 式:会場 & オンライン ハイブリッド開催
    ■会 場:大阪大学コンベンションセンター2階会議室3
    ■参加費:無料
    ■主 催:大阪大学先導的学際研究機構 創薬サイエンス部門
    ■後 催:国立研究開発法人日本医療研究開発機構(AMED)/日本製薬工業協会(製薬協)
    ■お申し込み参加フォーム
    ■お問い合わせ:大阪大学先導的学際研究機構 創薬サイエンス部門事務局 竹市 未帆
            E-mail:takeichi@phs.osaka-u.ac.jp

  • 2025.12.19 講演

    奥野教授が講演しました。
    第52回白金シンポジウム「in silico-driven創薬&臨床医療の最前線」
    2025/12/19 北里大学 大村記念ホール(東京)
    「AI は創薬を変革できるか」

  • 2025.12.19 講演

    奥野教授が講演しました。
    [理研AIP 成果報告イベント]iPS 細胞 x AI 成果ワークショップ
    2025/12/19 オンライン開催
    招待講演「AI は創薬を変革できるのか」

  • 2025.12.08 講演

    奥野教授が登壇しました。
    Healthtech Summit 2025
    2025/12/8 室町三井ホール&カンファレンス(COREDO室町テラス3F)
    セッション「高速化する創薬の現在地-In Silicoが実現する新しい創薬・臨床開発」

  • 2025.11.25 講演

    奥野教授が講演しました。
    Oncology Crosstalk Symposium 2025
    2025/11/25 ウェビナー形式のオンライン開催
    「AI が拓くデータ駆動型医療の未来」

  • 2025.11.23 講演

    奥野教授が講演しました。
    第35回日本医療薬学会年会
    2025/11/23 神戸国際会議場 1F メインホール
    特別講演3「AI/DXが拓くデータ駆動型創薬・医療」

  • 2025.11.21 講演

    奥野教授が滋賀医科大学にて講義を行いました。
    滋賀医科大学医学部医学科「医学特論」
    2025/11/21 滋賀医科大学 臨床講義棟
    「ビッグデータ・AI医療が拓く医療の未来」

  • 2025.11.18 講演

    奥野教授が講演しました。
    第9回ケモインフォマティクス秋の学校
    2025/11/18 奈良春日野国際フォーラム 能楽ホール
    招待講演4「DX platform for target discovery and drug design」

  • 2025.11.14 講演

    奥野教授が講演しました。
    IQVIA RWE Seminar
    2025/11/14 オンライン開催
    基調講演1「RWDを活用した生成AI基盤モデルの開発」

  • 2026.01.03 執筆

    奥野教授が企画立案された医学雑誌が発行されました。

    奥野教授および奧野Gメンバーの執筆が掲載されております。
    ・奥野恭史, 序文「はじめに」, p1

    ・内野詠一郎,「疾患発症予防とAI─個別化介入に向けた現在地と展望」, p3-7
    ・櫻木 実,「臨床データ起点の創薬標的探索─AIによるデータ駆動型アプローチ」, p21-26
    ・松本篤幸, 小山拓豊,「創薬DX実現に向けた低分子創薬AIの進展と展望」, p40-45
    ・千葉峻太郎,「核酸医薬のためのアンチセンス核酸のデータベースと活性予測技術」, p52-56
    ・小島諒介,「創薬計算技術 創薬のための分子深層学習ツールと基盤モデル」, p75-79

    ・荒木望嗣,「創薬計算技術 分子シミュレーション」, p90-95
    ・大塚教雄,「AIとシミュレーション技術に基づく創薬DXプラットフォームの開発」, p102-108
    医学のあゆみ』296巻1号「AI×ビッグデータが実現する創薬DX」
    (2026年1月発行)

  • 2025.05.25 執筆

    奧野Gメンバーの執筆が掲載されました。
    藤田暁, 後藤公志, 植田彰彦, 奥野恭史, 松田秀一,「4.生成AIの医用画像への応用――人工股関節全置換術後X線像の3D—CT化とカップアライメント評価」, 臨床雑誌「整形外科」 2025年5月増刊号, p620–626(2025年5月発行)

  • 2025.04.05 執筆

    奧野Gメンバーの執筆が掲載されました。
    奥野恭史, 荒木望嗣,「「富岳」で目指すシミュレーション・AI駆動型次世代医療・創薬」, 「臨床研究イノベーション2.0」, p152-160(2025年4月発行)

  • 2025.01.07 執筆

    奧野Gメンバーの執筆が掲載されました。
    山崎公裕, 和田裕一郎, 和田睦世, 河東孝, 德久淳師, 奥野恭史,「CryoEM画像群から多様な分子構造変化を予測する生成A I」, 「Medical Science Digest」2025年1月号, p12-15(2025年1月発行)

  • 2024.12.20 執筆

    奥野教授と奧野Gメンバーの執筆が掲載されました。
    奥野恭史,「創薬プロセスを革新するDX基盤」, p31-32

    小島諒介,「生命科学・創薬におけるマルチモーダルAIと基盤モデルへの展開」, p41-46
    戸﨑泰誠, 内野詠一郎, 奥野恭史,「臨床基盤モデル・マルチモーダル基盤モデルの現在地点」, p47-52
    実験医学』2025年1月号(2024年12月発行)

  • 2024.11.20 執筆

    奧野Gメンバーの執筆が掲載されました。
    松本篤幸, 岩田浩明, 奥野恭史,「AI・シミュレーションが切り拓くドラッグリポジショニング」, 月刊『細胞』2024年12月号, p22-25(2024年11月発行)

  • 2024.11.18 執筆

    奧野恭史教授の執筆が掲載されました。
    AlphaFoldの革新と挑戦:生命科学への応用と未来への展望」【特集】2024年のノーベル賞(AI×化学), 「化学」2024年12月号, p16-19 (2024年11月発行)

  • 2024.10.19 執筆

    奧野Gメンバーの執筆が掲載されました。
    Takuto Koyama, Yasushi Okuno, “The AI Trends in Chemical Space for Drug Discovery”, Drug Development Supported by Informatics, Springer, pp 1–8 , First Online: 19 October 2024

     

  • 2024.10.18 執筆

    奥野教授が国内外に向けて京都大学の研究者を紹介するビジュアルブック「KyotoU Future Commons」に紹介されました。
    KyotoU Future Commons」(125人の研究者が未来を語るビジュアルブック)- P.99

  • 2024.06.10 執筆

    奥野教授と奧野Gメンバーの執筆が掲載されました。
    奥野恭史,「PartⅠ1章 フロントランナーに聞く(座談会)」, p2-10

    小山拓豊, 奥野恭史,「PartⅡ6章 創薬化学における AIのトレンド」, p79-84
    CSJ50 化学における情報・AIの活用(2024年6月発行)

  • 2026.02.25 学会発表

    奥野Gメンバーが学会でポスター発表を行いました。

    Minoru Sakuragi, Tomomi Endo, Eri Muso, Takeshi Matsubara, & Tatsuo Tsukamoto.
    Effectiveness and safety of cyclophosphamide in induction therapy for elderly patients with microscopic polyangiitis and renal impairment: A 32-case series, IVW 2026, 2026/2/21-25, Melbourne, Australia

  • 2026.02.09 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    Minoru Sakuragi, Yasushi Okuno,”AI platform to accelerate drug discovery—Drug Discovery DX Platform”, Quantum Computing and Drug Discovery Symposium, 2026/2/9, IBM Research Lab, Cambridge, MA, USA

  • 2026.01.27 学会発表

    奥野Gメンバーが学会でポスター発表を行いました。

    S Chiba, K Kunitake, Y Aoki, T Yokota, Y Okuno,                                                            Prediction of exon-skipping antisense oligonucleotide activity through a genome foundation model”                                    SCA/HPCAsia 2026, 2026/1/27, Osaka International Convention Center, Osaka, Japan

  • 2025.11.26 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    千葉峻太朗, 邦武克彦, 青木吉嗣, 横田俊文, 奥野恭史, 
    「AIモデルによるエクソンスキッピングアンチセンス核酸の活性予測―ゲノム基盤モデルに基づく解析」
    2025年度疾患モデルを駆使した筋ジストロフィーの治療法開発研究班会議, 2025/11/26, 国立精神神経医療研究センター教育研修棟ユニバーサルホール

  • 2025.11.06 学会発表

    奥野Gメンバーが学会でポスター発表を行いました。

    Toshiaki Katayama, Shuichi Kawashima, Yuki Moriya, Ryosuke Kojima, Takuto Koyama, Mayumi Kamada, 
    “Accelerating Drug Discovery through Semantic Data Integration and Machine Learning: From Biomedical Knowledge Graphs to Predictive Models”
    ISWC 2025, 2025/11/2-6, Nara Prefectural Convention Center, Nara, Japan

  • 2025.10.31 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    峰晴陽平, 
    シンポジウム32「未来の脳血管障害の治療」
    「免疫制御に基づくコンパニオン診断薬による閉塞性脳血管障害の治療」
    日本脳神経外科学会第84回学術総会, 2025/10/31, パシフィコ横浜

  • 2025.10.29 学会発表

     

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    【ポスター発表】
    Takuto Koyama, Hiroaki Iwata, Ryosuke Kojima, Takao Otsuka, Aki Hasegawa, Teruki Honma, Shigeyuki Matsumoto, Yasushi Okuno, “Empowering Federated Learning for Robust Compound-Protein Interaction Prediction across Heterogeneous Cross-Pharma Domains“, 情報計算化学生物学会2025年大会(CBI2025), 2025/10/28-29, タワーホール船堀

    【口頭発表】
    SEUNGEON LEE, Takuto Koyama, Itsuki Maeda, Shigeyuki Matsumoto, Yasushi Okuno, “HELM-BERT: A Transformer for Medium-sized Peptide Property Prediction“, 情報計算化学生物学会2025年大会(CBI2025), 2025/10/29, タワーホール船堀

    Shuhei Tanaka, Taisei Tosaki, Nanae Aratake, Eiichiro Uchino, Yasushi Okuno, “Development of a Predictive Model for Type 2 Diabetes Onset Using Life Log and Health Checkup Data“, 情報計算化学生物学会2025年大会(CBI2025), 2025/10/29, タワーホール船堀

  • 2025.10.29 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    峰晴陽平, 
    一般演題口演「AIアプリを用いた特定保健指導の効果とその持続性:単アーム試験の結果から」
    第84回日本公衆衛生学会総会, 2025/10/29, 静岡県コンベンションアーツセンター

  • 2025.10.07 学会発表

    奥野Gメンバーが学会でポスター発表を行いました。

    Mineharu Y,  Uchino E,  Watanabe H, Hirai K, Yoshida A, Kojima R, Okuno Y, 
    “AI-Assisted Specific Health Guidance App for Lifestyle Disease Prevention and Stroke Prevention”
    European Association of Neurosurgical Societies 2025, 2025/10/7, Vienna, Austria

  • 2025.02.06 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    Mineharu Y, Kamata T, Tomoto M, Sato N, Tamada Y, Funaki T, Oichi Y, Harada KH, Koizumi A, Kimura T, et al., 
    “Peripheral blood GATA2 expression increases RNF213 mutation penetrance and clinical severity in moyamoya disease”
    International Stroke Conference, 2025/2/6, Los Angeles Convention Center | Los Angeles, California