論文

2023年10月2日 / 最終更新日 : 2023年10月30日 陽子土井 論文

Yamane T, Nakayama T, Ekimoto T, Inoue M, Ikezaki K, Sekiguchi H, Kuramochi M, Terao Y, Judai K, Saito M, Ikeguchi M, C. Sasaki Y　,Comparison of the Molecular Motility of Tubulin Dimeric Isoforms: Molecular Dynamics Simulations and Diffracted X-ray Tracking Study, International Journal of Molecular Sciences , 2,415,423,2023/10/2, https://www.mdpi.com/1422-0067/24/20/15423

2023年10月1日 / 最終更新日 : 2024年12月3日 市川 志奈 論文

Yamazaki K, Wada Y, Tokuhisa A, Wada M, Katoh T, Umeda Y, Okuno Y, Nakagawa A, An Auto-Encoder to Reconstruct Structure with Cryo-EM Images via Theoretically Guaranteed Isometric Latent Space, and Its Application for Automatically Computing the Conformational Pathway., Lecture Notes in Computer Science(including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), 14220 LNCS, 394-404, 2023/10/1, doi: 10.1007/978-3-031-43907-0_38

2023年9月30日 / 最終更新日 : 2023年10月30日 陽子土井 論文

Echizen H, Hanaoka K, Shimamoto K, Hibi R, Toma-Fukai S, Ohno H, Sasaki E, Komatsu T, Ueno T, Tsuchiya Y, Watanabe Y, Otsuka T, Saito H, Nagatoishi S, Tsumoto K, Kojima H, Okabe T, Shimizu T, Urano Y,”Discovery of a cystathionine γ-lyase (CSE) selective inhibitor targeting active-site pyridoxal 5′-phosphate (PLP) via Schiff base formation”, Scientific Reports  ,1,316,456,2023/9/30,  https://doi.org/10.1038/s41598-023-43536-6

2023年9月11日 / 最終更新日 : 2023年10月17日 陽子土井 論文

Hattori EY, Arakawa Y, Mineharu Y, Furukawa K, Terada Y, Yamao Y, Tanji M, Kikuchi T, Miyamoto S. , Seizure control by adding on other anti-seizure medication on seizure during levetiracetam administration in patients with glioma-related epilepsy.  , BMC Cancer  , 23, 849 , 2023/9/11 , doi.org/10.1186/s12885-023-11273-8

2023年8月23日 / 最終更新日 : 2023年7月25日 陽子土井 論文

Nakamura K, Uchino E, Sato N, Araki A, Terayama K, Kojima R, Murashita K, Itoh K, Mikami T, Tamada Y, Okuno Y , Individual health-disease phase diagrams for disease prevention based on machine learning , Journal of Biomedical Informatics , 144,104448 , 2023/8/23 , doi.org/10.1016/j.jbi.2023.104448

2023年8月23日 / 最終更新日 : 2023年10月17日 陽子土井 論文

Matsuoka T, Hattori A, Oishi S, Araki M, Biao Ma, Fujii T, Arichi N, Okuno Y, Kakeya H, Yamasaki S, Ohno H, Inuki S , Establishment of an MR1 Presentation Reporter Screening System and Identification of Phenylpropanoid Derivatives as MR1 Ligands. , Journal of medicinal chemistry , 66(17),12520–12535 , 2023/8/23 , doi.org/10.1021/acs.jmedchem.3c01122

2023年7月31日 / 最終更新日 : 2023年8月24日 陽子土井 論文

Nojima S#*, Kadoi T, Suzuki A, Kato C, Ishida S, Kido K, Fujita K, Okuno Y, M. Hirokawa, K. Terayama*, Morii E, , Deep-learning-based differential diagnosis of follicular thyroid tumors using histopathological images , Modern Pathology ,100296,2023/7/31, DOI: 10.1016/j.modpat.2023.100296

2023年7月21日 / 最終更新日 : 2023年7月31日 陽子土井 論文

Aya Nakamura, Ryosuke Kojima, Yuji Okamoto, Eiichiro Uchino, Yohei Mineharu, Yohei Harada, Mayumi Kamada, Manabu Muto, Motoko Yanagita, Yasushi Okuno , A New Deep State-Space Analysis Framework for Patient Latent State Estimation and Classification from EHR Time Series Data. , arXiv:2307.11487 , 2023/7/21 , https://doi.org/10.48550/arXiv.2307.11487

2023年7月17日 / 最終更新日 : 2023年8月18日 陽子土井 論文

Koyama T, Matsumoto S, Iwata H, Kojima R, Okuno Y. , Improving Compound–Protein Interaction Prediction by Self-Training with Augmenting Negative Samples , Journal of Chemical Information and Modeling , , 63, 15 , 4552–4559 , 2023/7/17 , https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.jcim.3c00269

2023年7月1日 / 最終更新日 : 2023年8月18日 陽子土井 論文

Hatano N, Kamada M, Kojima R, Okuno Y , Network-based prediction approach for cancer-specific driver missense mutations using a graph neural network. , bioRxiv , 2023/7 , https://doi.org/10.1101/2023.07.05.547896