• Department of Biomedical Data Intelligence,
    Graduate School of Medicine, Kyoto University

    当研究室では、京大病院の実臨床データを用いた医療ビッグデータ解析・医療シミュレーションや、スーパーコンピュータ「富岳」を用いた創薬シミュレーション・ビッグデータ創薬の新たな方法論開発に取り組み、医療応用と創薬応用を目的としたシミュレーション科学とデータ科学の開拓を目指しています。

Drug discovery創薬

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Medical医療

新着情報

  • 2026.08.08 講演

    奥野教授がご講演されました。

    日本学術会議・日本科学未来館 共同イベント「AIとワタシの未来予想図」

    第一部:生命科学セッション
        どう変わっていく? 医療と農業のAI革新
    第二部:パネル&グループディスカッション
        研究者と、みんなと、話してみよう! AIとワタシたちのこれから


    ■日 時:2026年8月8日(土)10時30分~13時00分
    ■会 場:日本科学未来館 7階 未来館ホール(東京都江東区青海2-3-6)  
    ■主 催:日本学術会議、日本科学未来館

  • 2026.08.03 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行い、優秀講演賞を受賞しました。

    李 昇彦、小山 拓人、前田 樹、松本 篤幸、奥野 恭史,
    HELM-BERT: Topology-Aware Representations for Chemically Modified Peptides,
    第18回 CBI若手の会講演会, 2026/8/3, オンライン
     
  • 2026.07.12 執筆

    奥野教授が共著執筆された医学雑誌が発行されました。

    「低分子創薬 AI における表現学習・相互作用理解・候補分子設計の進展」
    松本篤幸, 李 昇彦, 奥野恭史 共著 
    月間バイオインダストリー 第43巻, 第7号,『AI 創薬の最前線』,
    シーエムシー出版, p1-7, 2026年7月12日

  • 2026.06.15 執筆

    奥野教授が共著執筆された医学雑誌が発行されました。

    「アンチセンス核酸設計のための活性予測AI」千葉峻太朗, 奥野恭史 共著 
    実験医学 増刊号 Vol.44 No.10『最新の核酸医薬を知る、活かす』 ,
    羊土社, p71-77, 2026年6月15日

  • 2026.06.12 講演

    奥野教授がご講演されました。

    創薬懇話会2026 in 湯河原
    ■演 題:「AIは創薬を変革できるのか
    ■日 時:2026年6月12日(金)13時30分~17時00分
    ■会 場:ニューウェルシティ湯河原
         〒413-0001 静岡県熱海市泉107
    ■主 催:日本薬学会 医薬化学部会

  • 2026.06.06 学会発表

    奥野Gメンバーが学会でポスター発表を行いました。

    穴水和果奈, 櫻木実, 奥野恭史,
    「遺伝子発現データと知識グラフに基づく因果推論RPathの治療標的探索性能評価」,
    第8回日本メディカルAI学会学術集会, 2026/6/5-6, 虎ノ門ヒルズフォーラム

  • 2026.06.06 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    浅田梨湖, 戸﨑泰誠, 櫻木実, 鎌田真由美, 奥野恭史,
    「生活習慣病発症前早期の遺伝的寄与動態に基づくマルチモーダル層別化解析」, 第8回日本メディカルAI学会学術集会,
    2026/6/6, 虎ノ門ヒルズフォーラム  
     
  • 2026.06.05 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    “櫻木実,  浅田梨湖, 小野塚さくら, 鎌田真由美, 奥野恭史,
    シンポジウム2 ゲノム言語モデルの医学医療応用 「ゲノム言語モデルの医療研究応用:個別化医療と創薬標的探索への展望」 
    2026/6/5, 虎ノ門ヒルズフォーラム  
     
  • 2026.04.22 講演

    奥野教授がご講演されました。

    国立大学法人 奈良先端科学技術大学院大学主催
    ARWIT推進センターキックオフシンポジウム

    ■演 題:「AI駆動型科学への挑戦
    ■日 時:2026年4月22日(水)13時30分~17時00分
    ■会 場:京都テルサ西館1階 テルサホール
         〒601-8047 京都府京都市南区東九条下殿田町70番地
    ■主 催:国立大学法人 奈良先端科学技術大学院大学

  • 2026.03.26 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    Mitsugu Araki, Yasushi Okuno, “Mechanistic insights into oncogenic kinase mutations from multiscale molecular Simulations”, ACS National Meeting Spring 2026, 2026/3/22-26, Georgia World Congress Center, Atlanta, GA, USA

  • 2026.02.02 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました。 

    Sakuragi M, Miyauchi M, Kubo M, Aso M, Ogura S, Sokai Y, Tsuji Y, Mori KP, Torikoshi K, Suzuki H, Komiya T, Muso E, Endo T, Matsubara T, Tsukamoto T, Plasma Exchange for Anti-GBM Disease With Dialysis Dependency: A Case Series on Clinical Outcomes and Safety, Ther Apher Dial., 2026/2/2, Epub ahead of print., doi:10.1002/1744-9987.70121

  • 2026.01.30 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Koyama T, Tsumura H, Okita R, Yamazaki K, Hasegawa A, Imamura K, Kato T, Iwata H, Kojima R, Inoue H, Matsumoto S, Okuno Y, Chemical genomics language model toward reliable and explainable compound-protein interaction exploration, J Cheminform, 2026/1/30, Epub ahead of print., doi:10.1186/s13321-026-01155-z

  • 2026.01.10 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Koyama T, Iwata H, Kojima R, Otsuka T, Hasegawa A, Lee S, Ueda H, Morimoto T, Sasaki R, Torimoto N, Murakami S, Tojo M, Honma T, Matsumoto S, Okuno Y, Empowering federated learning for robust compound-protein interaction prediction across heterogeneous cross-pharma domains, J Cheminform, 18(1):16, 2026/1/10, doi:10.1186/s13321-025-01147-5

  • 2025.12.31 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Shunsuke Takayanagi, Keita P. Mori, Youngna Kang, Mitsugu Araki, Shigeyuki Matsumoto, Yukari Sagae, Nana Sakakibara, Tomoko Horinouchi, Yoshiaki Higashi, Tomomi Endo, Eri Muso, Kandai Nozu, Yasushi Okuno, Motoko Yanagita, Takeshi Matsubara, and Tatsuo Tsukamoto, Functional analysis of a novel pathogenic glycine amidinotransferase mutant in hereditary Fanconi syndrome, Kidney Medicine, 2025, (In press)

  • 2025.12.29 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Seungeon Lee, Takuto Koyama, Itsuki Maeda, Shigeyuki Matsumoto, Yasushi Okuno, HELM-BERT: A Transformer for Medium-Sized Peptide Property Prediction, arXiv:2512.23175, 2025/12/29, https://arxiv.org/abs/2512.23175

  • 2025.12.24 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Fukushima Y, Wang Y, Yada-Makino Y, Komuro H, Demachi-Okamura A, Sugita Y, Okamoto T, Ishihara H, Mizuta R, Sun Y, Matsui T, Araki M, Biao M, Okuno Y, Masago K, Yamaguchi R, Guo Z, Onoguchi K, Yamashita Y, Fukuyama T, Nabekura T, Matsushita H, Iwata H, Muraoka D, Functional and structural analysis of KK-LC-1-specific T cell receptors from patients with lung Cancer for immunotherapy, Cell Immunol, 419:105059, 2025/12/24,  Epub ahead of print., doi:10.1016/j.cellimm.2025.105059

  • 2025.11.27 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Bekker GJ, Araki M, Oshima K, Okuno Y, Kamiya N, Molecular recognition of natural compounds by MR1 and their implication in MAIT cell activation elucidated through McMD-based dynamic docking simulations, Sci Rep., 15(1):45487, 2025/11/27, doi:10.1038/s41598-025-28682-3

  • 2025.11.10 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Ito S*, Koyama, T*, Matsumoto S, Kojima R, Okamoto Y, Kuroda M, Kawashima H, Watanabe R, Yonezawa T, Sumiyoshi T, Ikeda K, Mizuguchi K, Iwata H, Okuno Y, Improving ADME Prediction with Multitask Graph Neural Networks and Assessing Explainability in Lead Optimization, J Chem Inf Model, 65(21):11796-11803, 2025/11/10, Epub 2025 Oct 22, doi:10.1021/acs.jcim.5c00758

  • 2025.11.10 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Yuji Okamoto, Transformers for Time-Series Forecasting: A Comprehensive Survey through 2024, NOLTA, E17-N(1), 2026/1, (In press)

  • 2025.11.06 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Toshiaki Katayama, Shuichi Kawashima, Yuki Moriya, Ryosuke Kojima, Takuto Koyama, Mayumi Kamada, Accelerating Drug Discovery through Semantic Data Integration and Machine Learning: From Biomedical Knowledge Graphs to Predictive Models, ISWC 2025 Companion Volume(Poster Presentation), 2025/11/2-6

  • 2026.08.08 講演

    奥野教授がご講演されました。

    日本学術会議・日本科学未来館 共同イベント「AIとワタシの未来予想図」

    第一部:生命科学セッション
        どう変わっていく? 医療と農業のAI革新
    第二部:パネル&グループディスカッション
        研究者と、みんなと、話してみよう! AIとワタシたちのこれから


    ■日 時:2026年8月8日(土)10時30分~13時00分
    ■会 場:日本科学未来館 7階 未来館ホール(東京都江東区青海2-3-6)  
    ■主 催:日本学術会議、日本科学未来館

  • 2026.06.12 講演

    奥野教授がご講演されました。

    創薬懇話会2026 in 湯河原
    ■演 題:「AIは創薬を変革できるのか
    ■日 時:2026年6月12日(金)13時30分~17時00分
    ■会 場:ニューウェルシティ湯河原
         〒413-0001 静岡県熱海市泉107
    ■主 催:日本薬学会 医薬化学部会

  • 2026.04.22 講演

    奥野教授がご講演されました。

    国立大学法人 奈良先端科学技術大学院大学主催
    ARWIT推進センターキックオフシンポジウム

    ■演 題:「AI駆動型科学への挑戦
    ■日 時:2026年4月22日(水)13時30分~17時00分
    ■会 場:京都テルサ西館1階 テルサホール
         〒601-8047 京都府京都市南区東九条下殿田町70番地
    ■主 催:国立大学法人 奈良先端科学技術大学院大学

  • 2026.03.12 講演

    奥野教授がご講演されました。
    立命館大学薬学部シンポジウム「データサイエンスと薬学」
    招待講演「AI/DX駆動型創薬の未来」

    ■日 時:2026年3月12日(木)13:00~18:00
    ■形 式:対面/オンライン ハイブリッド開催
    ■会 場:立命館大学 びわこくさつキャンパス(BKC) ローム記念館 5F 大会議室
    ■参加費:無料
    ■主 催:立命館大学 薬学部
    ■お申し込み参加フォーム
    ■お問い合わせ:立命館大学薬学部
            E-mail:yak-conc@st.ritsumei.ac.jp

  • 2026.01.30 講演

    奥野教授がご講演されました。
    令和7年度先導的学際研究機構創薬サイエンス部門シンポジウム
    基調講演「AIは創薬を変革できるか」

    ■日 時:2026年1月30日(金)13:00~16:00
    ■形 式:会場 & オンライン ハイブリッド開催
    ■会 場:大阪大学コンベンションセンター2階会議室3
    ■参加費:無料
    ■主 催:大阪大学先導的学際研究機構 創薬サイエンス部門
    ■後 催:国立研究開発法人日本医療研究開発機構(AMED)/日本製薬工業協会(製薬協)
    ■お申し込み参加フォーム
    ■お問い合わせ:大阪大学先導的学際研究機構 創薬サイエンス部門事務局 竹市 未帆
            E-mail:takeichi@phs.osaka-u.ac.jp

  • 2025.12.19 講演

    奥野教授が講演しました。
    第52回白金シンポジウム「in silico-driven創薬&臨床医療の最前線」
    2025/12/19 北里大学 大村記念ホール(東京)
    「AI は創薬を変革できるか」

  • 2025.12.19 講演

    奥野教授が講演しました。
    [理研AIP 成果報告イベント]iPS 細胞 x AI 成果ワークショップ
    2025/12/19 オンライン開催
    招待講演「AI は創薬を変革できるのか」

  • 2025.12.08 講演

    奥野教授が登壇しました。
    Healthtech Summit 2025
    2025/12/8 室町三井ホール&カンファレンス(COREDO室町テラス3F)
    セッション「高速化する創薬の現在地-In Silicoが実現する新しい創薬・臨床開発」

  • 2025.11.25 講演

    奥野教授が講演しました。
    Oncology Crosstalk Symposium 2025
    2025/11/25 ウェビナー形式のオンライン開催
    「AI が拓くデータ駆動型医療の未来」

  • 2025.11.23 講演

    奥野教授が講演しました。
    第35回日本医療薬学会年会
    2025/11/23 神戸国際会議場 1F メインホール
    特別講演3「AI/DXが拓くデータ駆動型創薬・医療」

  • 2026.07.12 執筆

    奥野教授が共著執筆された医学雑誌が発行されました。

    「低分子創薬 AI における表現学習・相互作用理解・候補分子設計の進展」
    松本篤幸, 李 昇彦, 奥野恭史 共著 
    月間バイオインダストリー 第43巻, 第7号,『AI 創薬の最前線』,
    シーエムシー出版, p1-7, 2026年7月12日

  • 2026.06.15 執筆

    奥野教授が共著執筆された医学雑誌が発行されました。

    「アンチセンス核酸設計のための活性予測AI」千葉峻太朗, 奥野恭史 共著 
    実験医学 増刊号 Vol.44 No.10『最新の核酸医薬を知る、活かす』 ,
    羊土社, p71-77, 2026年6月15日

  • 2026.01.03 執筆

    奥野教授が企画立案された医学雑誌が発行されました。

    奥野教授および奧野Gメンバーの執筆が掲載されております。
    ・奥野恭史, 序文「はじめに」, p1

    ・内野詠一郎,「疾患発症予防とAI─個別化介入に向けた現在地と展望」, p3-7
    ・櫻木 実,「臨床データ起点の創薬標的探索─AIによるデータ駆動型アプローチ」, p21-26
    ・松本篤幸, 小山拓豊,「創薬DX実現に向けた低分子創薬AIの進展と展望」, p40-45
    ・千葉峻太郎,「核酸医薬のためのアンチセンス核酸のデータベースと活性予測技術」, p52-56
    ・小島諒介,「創薬計算技術 創薬のための分子深層学習ツールと基盤モデル」, p75-79

    ・荒木望嗣,「創薬計算技術 分子シミュレーション」, p90-95
    ・大塚教雄,「AIとシミュレーション技術に基づく創薬DXプラットフォームの開発」, p102-108
    医学のあゆみ』296巻1号「AI×ビッグデータが実現する創薬DX」
    (2026年1月発行)

  • 2025.05.25 執筆

    奧野Gメンバーの執筆が掲載されました。
    藤田暁, 後藤公志, 植田彰彦, 奥野恭史, 松田秀一,「4.生成AIの医用画像への応用――人工股関節全置換術後X線像の3D—CT化とカップアライメント評価」, 臨床雑誌「整形外科」 2025年5月増刊号, p620–626(2025年5月発行)

  • 2025.04.05 執筆

    奧野Gメンバーの執筆が掲載されました。
    奥野恭史, 荒木望嗣,「「富岳」で目指すシミュレーション・AI駆動型次世代医療・創薬」, 「臨床研究イノベーション2.0」, p152-160(2025年4月発行)

  • 2025.01.07 執筆

    奧野Gメンバーの執筆が掲載されました。
    山崎公裕, 和田裕一郎, 和田睦世, 河東孝, 德久淳師, 奥野恭史,「CryoEM画像群から多様な分子構造変化を予測する生成A I」, 「Medical Science Digest」2025年1月号, p12-15(2025年1月発行)

  • 2024.12.20 執筆

    奥野教授と奧野Gメンバーの執筆が掲載されました。
    奥野恭史,「創薬プロセスを革新するDX基盤」, p31-32

    小島諒介,「生命科学・創薬におけるマルチモーダルAIと基盤モデルへの展開」, p41-46
    戸﨑泰誠, 内野詠一郎, 奥野恭史,「臨床基盤モデル・マルチモーダル基盤モデルの現在地点」, p47-52
    実験医学』2025年1月号(2024年12月発行)

  • 2024.11.20 執筆

    奧野Gメンバーの執筆が掲載されました。
    松本篤幸, 岩田浩明, 奥野恭史,「AI・シミュレーションが切り拓くドラッグリポジショニング」, 月刊『細胞』2024年12月号, p22-25(2024年11月発行)

  • 2024.11.18 執筆

    奧野恭史教授の執筆が掲載されました。
    AlphaFoldの革新と挑戦:生命科学への応用と未来への展望」【特集】2024年のノーベル賞(AI×化学), 「化学」2024年12月号, p16-19 (2024年11月発行)

  • 2024.10.19 執筆

    奧野Gメンバーの執筆が掲載されました。
    Takuto Koyama, Yasushi Okuno, “The AI Trends in Chemical Space for Drug Discovery”, Drug Development Supported by Informatics, Springer, pp 1–8 , First Online: 19 October 2024

     

  • 2026.08.03 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行い、優秀講演賞を受賞しました。

    李 昇彦、小山 拓人、前田 樹、松本 篤幸、奥野 恭史,
    HELM-BERT: Topology-Aware Representations for Chemically Modified Peptides,
    第18回 CBI若手の会講演会, 2026/8/3, オンライン
     
  • 2026.06.06 学会発表

    奥野Gメンバーが学会でポスター発表を行いました。

    穴水和果奈, 櫻木実, 奥野恭史,
    「遺伝子発現データと知識グラフに基づく因果推論RPathの治療標的探索性能評価」,
    第8回日本メディカルAI学会学術集会, 2026/6/5-6, 虎ノ門ヒルズフォーラム

  • 2026.06.06 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    浅田梨湖, 戸﨑泰誠, 櫻木実, 鎌田真由美, 奥野恭史,
    「生活習慣病発症前早期の遺伝的寄与動態に基づくマルチモーダル層別化解析」, 第8回日本メディカルAI学会学術集会,
    2026/6/6, 虎ノ門ヒルズフォーラム  
     
  • 2026.06.05 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    “櫻木実,  浅田梨湖, 小野塚さくら, 鎌田真由美, 奥野恭史,
    シンポジウム2 ゲノム言語モデルの医学医療応用 「ゲノム言語モデルの医療研究応用:個別化医療と創薬標的探索への展望」 
    2026/6/5, 虎ノ門ヒルズフォーラム  
     
  • 2026.03.26 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    Mitsugu Araki, Yasushi Okuno, “Mechanistic insights into oncogenic kinase mutations from multiscale molecular Simulations”, ACS National Meeting Spring 2026, 2026/3/22-26, Georgia World Congress Center, Atlanta, GA, USA

  • 2026.03.21 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    荒武 奈々瑛, 戸﨑泰誠, 田中周平, 内野詠一郎, 奥野恭史,
    「健診・生活習慣データを用いた労働者の生活の質・労働生産性の悪化予測モデル構築」, 第96回日本衛生学会学術総会,
    2026/3/21, 栃木県総合文化センター       
  • 2026.02.24 学会発表

    奥野Gメンバーが学会でポスター発表を行いました。

    Mitsugu Araki, Yasushi Okuno,
    “GENOME-INFORMED MOLECULAR SIMULATIONS REVEAL MECHANISTIC LINKS BETWEEN ONCOGENIC KINASE MUTATIONS, STRUCTURAL DYNAMICS, AND DRUG RESISTANCE, Biophysical Society 70th annual meeting, 2026/2/24, San Francisco, CA, USA

  • 2026.02.21 学会発表

    奥野Gメンバーが学会でポスター発表を行いました。

    Minoru Sakuragi, Tomomi Endo, Eri Muso, Takeshi Matsubara, & Tatsuo Tsukamoto.
    Effectiveness and safety of cyclophosphamide in induction therapy for elderly patients with microscopic polyangiitis and renal impairment: A 32-case series, IVW 2026, 2026/2/21-25, Melbourne, Australia

  • 2026.02.14 学会発表

    奥野Gメンバーが学会でポスター発表を行いました。

    Minoru Sakuragi, Yasushi Okuno,
    GENOME-INFORMED MOLECULAR SIMULATIONS REVEAL MECHANISTIC LINKS BETWEEN ONCOGENIC KINASE MUTATIONS, STRUCTURAL DYNAMICS, AND DRUG RESISTANCE,
    Biophysical Society 70th annual meeting, 2026/2/24, San Francisco, CA, USA

  • 2026.02.09 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    Minoru Sakuragi, Yasushi Okuno, “AI platform to accelerate drug discovery—Drug Discovery DX Platform”, Quantum Computing and Drug Discovery Symposium, 2026/2/9, IBM Research Lab, Cambridge, MA, USA

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