• Department of Biomedical Data Intelligence,
    Graduate School of Medicine, Kyoto University

    当研究室では、京大病院の実臨床データを用いた医療ビッグデータ解析・医療シミュレーションや、スーパーコンピュータ「富岳」を用いた創薬シミュレーション・ビッグデータ創薬の新たな方法論開発に取り組み、医療応用と創薬応用を目的としたシミュレーション科学とデータ科学の開拓を目指しています。

Drug discovery創薬

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Medical医療

新着情報

  • 2024.12.20 執筆

    奥野教授と奧野Gメンバーの執筆が掲載されました。
    奥野恭史,「創薬プロセスを革新するDX基盤」, p31-32

    戸﨑泰誠, 内野詠一郎, 奥野恭史,「臨床基盤モデル・マルチモーダル基盤モデルの現在地点」, p47-52
    実験医学』2025年1月号(2024年12月発行)

  • 2024.11.27 講演

    戸崎泰誠さんが講演しました。
    京都大学基金感謝の集い2024
    2024/11/27 京都大学百周年時計台記念館
    「医療AIで目指す未来」

  • 2024.11.22 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Igarashi Y, Hasegawa A, Matsumoto S, Iwata H, Kojima R, Okuno Y, Yamada H, Constructing a graph neural network-based artificial intelligence model to predict drug-induced phospholipidosis potential, Fundamental Toxicological Sciences, 11(6):279-288, 2024/11/22, doi:10.2131/fts.11.279

  • 2024.11.20 執筆

    奧野Gメンバーの執筆が掲載されました。
    松本篤幸, 岩田浩明, 奥野恭史,「AI・シミュレーションが切り拓くドラッグリポジショニング」, 月刊『細胞』2024年12月号, p22-25(2024年11月発行)

  • 2024.11.18 執筆

    奧野恭史教授の執筆が掲載されました。
    AlphaFoldの革新と挑戦:生命科学への応用と未来への展望」【特集】2024年のノーベル賞(AI×化学), 「化学」2024年12月号, p16-19 (2024年11月発行)

  • 2024.11.11 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Toda Y, Fujita H, Mino K, Koyama T, Matsuoka S, Kaizuka T, Agawa M, Matsumoto S, Idei A, Nishikori M, Okuno Y, Osada H, Yoshida M, Takaori-Kondo A, Iwai K, Synergistic involvement of the NZF domains of the LUBAC accessory subunits HOIL-1L and SHARPIN in the regulation of LUBAC function, Cell Death & Disease, 15(11):813, 2024/11/11, doi:10.1038/s41419-024-07199-z

  • 2024.11.11 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Sasagasako T, Ueda A, Mineharu Y, Mochizuki Y, Doi S, Park S, Terada Y, Sano N, Tanji M, Arakawa Y, Okuno Y, Postoperative Karnofsky performance status prediction in patients with IDH wild-type glioblastoma: A multimodal approach integrating clinical and deep imaging features, PLoS One, 11;19(11):e0303002, 2024/11/11, doi:10.1371/journal.pone.0303002

  • 2024.11.02 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    峰晴陽平, 奥野恭史, 
    シンポジウム:医療分野における LLM / LMM の研究開発
    「民間企業と連携したAI技術開発と人材養成:京都大学での取り組み」
    Clinical AI AI-MAILs 第4回合同シンポジウム, 2024/11/2, オンライン開催

  • 2024.11.02 講演

    奥野教授が講演しました。
    第32回日本消化器関連学会(JDDW 2024)
    2024/11/2 神戸国際会議場 第13会場
    医療セミナー「生成AIで変わる診療・研究・教育」
    「AI・シミュレーションによる創薬DX」

  • 2024.10.31 受賞

    奥野Gメンバーが受賞しました。
    情報計算化学生物学会2024年大会(CBI2024)

    口頭発表賞
    金澤 夏樹
    Large-scale MD-based CPI Prediction Using Supercomputer “Fugaku”
    Natsuki Kanazawa, Shigeyuki Matsumoto, Shuntaro Chiba, Yuta Isaka, Kiyoshi Takemura, Mitsugu Araki, Biao Ma, Takao Otsuka, Hiroaki Iwata, Kei Terayama, Yasushi Okuno

  • 2024.11.22 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Igarashi Y, Hasegawa A, Matsumoto S, Iwata H, Kojima R, Okuno Y, Yamada H, Constructing a graph neural network-based artificial intelligence model to predict drug-induced phospholipidosis potential, Fundamental Toxicological Sciences, 11(6):279-288, 2024/11/22, doi:10.2131/fts.11.279

  • 2024.11.11 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Toda Y, Fujita H, Mino K, Koyama T, Matsuoka S, Kaizuka T, Agawa M, Matsumoto S, Idei A, Nishikori M, Okuno Y, Osada H, Yoshida M, Takaori-Kondo A, Iwai K, Synergistic involvement of the NZF domains of the LUBAC accessory subunits HOIL-1L and SHARPIN in the regulation of LUBAC function, Cell Death & Disease, 15(11):813, 2024/11/11, doi:10.1038/s41419-024-07199-z

  • 2024.11.11 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Sasagasako T, Ueda A, Mineharu Y, Mochizuki Y, Doi S, Park S, Terada Y, Sano N, Tanji M, Arakawa Y, Okuno Y, Postoperative Karnofsky performance status prediction in patients with IDH wild-type glioblastoma: A multimodal approach integrating clinical and deep imaging features, PLoS One, 11;19(11):e0303002, 2024/11/11, doi:10.1371/journal.pone.0303002

  • 2024.10.22 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Yamaji K, Kanenawa K, Morofuji T, Nishikawa R, Imada K, Kohjitani H, Watanabe H, Tazaki J, Taniwaki M, Koga S, Akashi R, Kubo S, Ohya M, Kikuchi T, Ohira H, Numasawa Y, Arikawa M, Iwama M, Kitai T, Kobayashi Y, Shiomi H, Tada T, Yamaji Y, Daidoji H, Ohtani H, Furukawa Y, Kadota K, Toyofuku M, Ando K, Ono K, Kimura T; PREDICTOR investigators, Serial Optical Coherence Tomography Assessment of Coronary Atherosclerosis and Long-Term Clinical Outcomes., J Am Heart Assoc., 13(21):e034458, 2024/10/22, doi:10.1161/JAHA.123.034458

  • 2024.10.12 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Mitsugu A, Toru E, Kazuhiro T, Shigeyuki M, Yunoshin T, Hironori K, Gert-Jan B, Tsutomu Y, Yuta I, Yukari S, Narutoshi K, Mitsunori I, Yasushi O, Molecular Dynamics Unveils Multiple-Site Binding of Inhibitors with Reduced Activity on the Surface of Dihydrofolate Reductase, Journal of the American Chemical Society, 2024/10/12, In press, doi:10.1021/jacs.4c04648

  • 2024.08.27 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Tomoki S, Yohei M, Takeshi F, Yasutaka F, Hideo C, Silsu P, Kota N, Yasuzumi M, Masakazu O, Takayuki K, Yoshiki A, RNF213 Mutation Associated with the Progression from Middle Cerebral Artery Steno-Occlusive Disease to Moyamoya Disease, Translational stroke research, Advance online publication, 2024/8/27, doi:10.1007/s12975-024-01293-2

  • 2024.08.21 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Hosoya K, Ozasa H, Tanji M, Yoshida H, Ajimizu H, Tsuji T, Yoshida H, Terada Y, Sano N, Mineharu Y, et al., Performance status improvement and advances in systemic treatment after brain metastases resection: a retrospective single-center cohort study of non-small cell lung cancer patients, BMC Cancer, 2024;24(1):1030, 2024/8/21, doi:10.1186/s12885-024-12798-2

  • 2024.08.07 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Cun Y, Guo W, Ma B, Okuno Y, Wang J. Decoding the specificity of m6A RNA methylation and its implication in cancer therapy. Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy, 32(8):2461-2469, 2024/8/7, doi:10.1016/j.ymthe.2024.05.035

  • 2024.06.26 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Nishiwaki S, Shizuta S, Inoue T, Morinaga A, Yoneda F, Tanaka M, Aizawa T, Kohjitani H, Ono K, Prevalence and characteristics of atrioventricular nodal reentrant tachycardia with a bystander concealed nodoventricular/nodofascicular pathway, Heart Rhythm, S1547-5271(24)02823-6,  2024/6/26, doi:10.1016/j.hrthm.2024.06.049

  • 2024.05.30 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Taisei Tosaki, Eiichiro Uchino, Ryosuke Kojima, Yohei Mineharu, Mikio Arita, Nobuyuki Miyai, Yoshinori Tamada, Tatsuya Mikami, Koichi Murashita, Shigeyuki Nakaji, Yasushi Okuno, Out-of-distribution Reject Option Method for Dataset Shift Problem in Early Disease Onset Prediction. arXiv.org. 2024;09:14:01, 2024/5/30, doi.org/10.48550/arXiv.2405.19864

  • 2024.11.27 講演

    戸崎泰誠さんが講演しました。
    京都大学基金感謝の集い2024
    2024/11/27 京都大学百周年時計台記念館
    「医療AIで目指す未来」

  • 2024.11.02 講演

    奥野教授が講演しました。
    第32回日本消化器関連学会(JDDW 2024)
    2024/11/2 神戸国際会議場 第13会場
    医療セミナー「生成AIで変わる診療・研究・教育」
    「AI・シミュレーションによる創薬DX」

  • 2024.10.30 講演

    奥野教授をはじめ当研究室の先生方が講演しました。
    CBI学会2024年大会
    2024/10/30 タワーホール船堀
    スポンサードセッション「LINCが目指す創薬DXプラットフォーム」
    「創薬DXプラットフォームの概要と進捗」 奥野 恭史((一社)ライフ インテリジェンス コンソーシアム)
    「ベイジアンネットにより標的分子探索」  玉田 嘉紀(弘前大学大学院 医学研究科)
    「HPCによる超大量ドッキングとAIによる巨大空間の探索」 大田 雅照(理化学研究所 計算科学研究センター)
    「化合物生成AIのアルゴリズム」 寺山 慧(横浜市立大学大学院 生命医科学研究科)
    「Federated Learningの紹介」 小島 諒介(京都大学大学院 医学研究科)

  • 2024.10.26 講演

    奥野教授が講演しました。
    第62回日本癌治療学会学術集会
    2024/10/26 福岡国際会議場
    会長企画 教育シンポジウム2「医学・医療における生成AIの可能性と課題」
    「生成AIは創薬を変革できるのか」

  • 2024.10.10 講演

    奥野教授が東京大学にて講義を行いました。
    東京大学医学部医学科「薬理学特別講義」
    2024/10/10 東京大学 本郷キャンパス
    「AIは創薬を変革できるのか」

  • 2024.10.09 講演

    奥野教授が講演しました。
    BioJapan2024
    2024/10/9 パシフィコ横浜
    主催者セミナー:コホート研究から世界最先端のヘルスケア産業を!
    「AIによる疾患発症予測と予防戦略」

    スポンサーセミナー:理化学研究所
    「AIは創薬を変革できるのか」

  • 2024.09.21 講演

    奥野教授が講演しました。
    第29回日本糖尿病教育・看護学会学術集会
    2024/9/21 国立京都国際会館
    特別講演「AI・ビッグデータが拓く医療の新しいカタチ」

  • 2024.09.20 講演

    奥野教授が講演しました。
    ARO協議会第11回学術集会
    2024/9/20 神戸国際会議場
    特別講演「AI・シミュレーションが画期的新薬を生み出す未来」

  • 2024.09.16 講演

    奥野教授が講演しました。
    日本薬物動態学会第39回年会/26th North American ISSX Meeting(日米合同薬物動態学会)
    2024/9/15 Hilton Hawaiian Village, Waikiki Beach Resort, Honolulu, Hawaii, USA
    Keynote Lecture「AI platform to accelerate drug discovery」

  • 2024.09.06 講演

    奥野教授が講演しました。
    神戸リサーチコンプレックス協議会シンポジウム「データで導くヘルスケアイノベーション」
    2024/9/6 スペースアルファ三宮(神戸)および Zoomウェビナー(ハイブリッド開催)
    基調講演「生成AI時代のヘルスケアDX」

  • 2024.11.02 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    峰晴陽平, 奥野恭史, 
    シンポジウム:医療分野における LLM / LMM の研究開発
    「民間企業と連携したAI技術開発と人材養成:京都大学での取り組み」
    Clinical AI AI-MAILs 第4回合同シンポジウム, 2024/11/2, オンライン開催

  • 2024.10.31 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    【口頭発表】

    Hayato Tsumura, Narumi Hatano, Mayumi Kamada, Ryosuke Kojima, Hiroaki Iwata, Yasushi Okuno,  “Predicting Novel Therapeutic Target Molecules Using Neural Networks: Validation and Applicability to Unknown Diseases“, 情報計算化学生物学会2024年大会(CBI2024) , 2024/10/30 ,タワーホール船堀

    Natsuki Kanazawa, Shigeyuki Matsumoto, Shuntaro Chiba, Yuta Isaka, Kiyoshi Takemura, Mitsugu Araki, Biao Ma, Takao Otsuka, Hiroaki Iwata, Kei Terayama, Yasushi Okuno,  “Large-scale MD-based CPI Prediction Using Supercomputer “Fugaku”“, 情報計算化学生物学会2024年大会(CBI2024) , 2024/10/31 ,タワーホール船堀

  • 2024.10.24 学会発表

    奥野Gメンバーが学会でポスター発表を行いました。

    Hayato Tsumura, Narumi Hatano, Mayumi Kamada, Ryosuke Kojima, Hiroaki Iwata, Yasushi Okuno, “Neural Network-Based Prediction of Therapeutic Targets Using Gene Expression Data of Diseases and Gene Perturbations”, APBJC2024, 2024/10/24, Naha Cultural Arts Theater NAHArt, Okinawa, Japan

  • 2024.10.18 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    千葉峻太朗, 奥野恭史, 
    理研の「AI for Science」 取り組み最前線
    「創薬DXプラットフォームで切り拓く創薬イノベーション」
    CEATEC2024, 2024/10/18, 幕張メッセ

  • 2024.10.16 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。
    峰晴 陽平, 鎌田 貴彦, 戸本 芽生, 佐藤 憲明, 玉田 嘉紀, 舟木 健史, 原田 浩二, 木村 哲晃, 井上 逸郎, 尾市 雄輝, 朴 実樹, 笹ヶ迫 知紀, 奥野 恭史, 宮本 享, 荒川 芳輝
    シンポジウム10:脳血管障害に対するトランスレーショナルリサーチ
    「RNF213変異とGATA2を含む脂質免疫遺伝子 モジュールが頭蓋内主幹動脈狭窄の臨床像と関連する ~2型炎症の重要性~」

    笹ケ迫 知紀, 峰晴 陽平, 舟木 健史, 伏見 育崇, 千原 英夫, 朴 実樹, 中嶋 広太, 大川 将和, 菊池 隆幸, 荒川 芳輝
    一般口演11:もやもや病01 遺伝子関連
    「RNF213 p.R4810K遺伝子変異は中大脳動脈狭窄症からもやもや病への進行に関与する」
    日本脳神経外科学会 第83回学術総会, 2024/10/16, パシフィコ横浜ノース

  • 2024.09.21 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。
    峰晴陽平, 内野詠一郎, 渡邊拡人, 平井啓, 吉田安里, 小島諒介, 奥野恭史
    シンポジウム5:医療におけるAI活用の多様なアプローチ「個人に寄り添う健診補助AIアプリの実証研究:COMPASS study」
    ARO協議会第11回学術集会, 2024/9/21, 神戸国際会議場

  • 2024.09.03 学会発表

    奥野Gメンバーが学会でポスター発表を行いました。

    Taisei Tosaki, Eiichiro Uchino, Yohei Harada, Minoru Sakuragi, Yusuke Koyanagi, Seiji Okajima, Hirofumi Suzuki, Kentaro Kanamori, Masahiro Asaoka, Kouji Kurihara, Takuya Takagi, Koji Maruhashi, Yoshinori Tamada, Tatsuya Mikami, Koichi Murashita, Shigeyuki Nakaji, Yasushi Okuno,  “Subgrouping Causal Networks of Disease Onset in Large-scale Health and Medical Data using Supercomputer Fugaku”, RIKEN Summer School 2024,  2024/9/2-3, Kobe, Japan

  • 2024.08.25 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    森脇圭, 中村和貴, 石田高志, 内野詠一郎, 奥野恭史, 玉田嘉紀, 伊東健, 村下公一, 三上達也, 中路重之,「弘前市岩木地区住民における睡眠とインフルエンザ罹患との関連 -免疫力向上に対する寄与への検討-」, 第32回体力·栄養·免疫学会大会 , 2024/8/25, 別府大学 大分

  • 2024.08.21 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    【ポスター発表】

    Tatsuki Yamamoto, Yuzuha Tsuji, Minoru Sakuragi , Yuji Okamoto , Mayumi Kamada , Yasushi Okuno,  “What Happens to Cancer Patients before They Die? Extracting the Dynamics of Mortality Factors using Machine Learning”, LINC SHOWCASE 2024 Summer, 2024/8/21, グランフロント大阪

    Takuto Koyama, Hayato Tsumura, Shigeyuki Matsumoto, Ryunosuke Okita, Ryosuke Kojima, Yasushi Okuno,  “ChemGLaM: Compound-Protein Interaction Prediction Using Large Language Models”, LINC SHOWCASE 2024 Summer, 2024/8/21, グランフロント大阪

    Hyeri Lim, Shigeyuki Matsumoto, Shuntaro Chiba, Tsutomu Yamane, Masateru Ohta, Yasushi Okuno,  “Evaluation of Protein-Peptide Docking Models Using Large Language Models and Interaction Descriptors”, LINC SHOWCASE 2024 Summer, 2024/8/21, グランフロント大阪

    池上 莉理子, 内野 詠一郎, 小島 諒介, 玉田 嘉紀, 三上 達也, 村下 公一, 中路 重之, 奥野 恭史,  “弘前健診データを用いた個人の「生活習慣ー疾患発症ネットワーク」の時系列推移パターン解析”, LINC SHOWCASE 2024 Summer, 2024/8/21, グランフロント大阪

    小林 侑大, 大塚 教雄, 奥野 恭史,  “量子化学計算情報の深層学習による分子間相互作用エネルギーの高精度・高効率予測”, LINC SHOWCASE 2024 Summer, 2024/8/21, グランフロント大阪

  • 2024.07.19 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    峰晴 陽平, 鎌田 貴彦, 戸本 芽生, 佐藤 憲明, 玉田 嘉紀, 舟木 健史, 原田 浩二, 木村 哲晃, 井上 逸郎, 尾市 雄輝, 朴 実樹, 笹ヶ迫 知紀, 奥野 恭史, 宮本 享, 荒川 芳輝,「末梢血のGATA2の発現上昇がRNF213変異の浸透率上昇ともやもや病の重症化に関連する」, 第24回日本分子脳神経外科学会 , 2024/7/19, ホテルマリターレ創世 佐賀