• Department of Biomedical Data Intelligence,
    Graduate School of Medicine, Kyoto University

    当研究室では、京大病院の実臨床データを用いた医療ビッグデータ解析・医療シミュレーションや、スーパーコンピュータ「富岳」を用いた創薬シミュレーション・ビッグデータ創薬の新たな方法論開発に取り組み、医療応用と創薬応用を目的としたシミュレーション科学とデータ科学の開拓を目指しています。

Drug discovery創薬

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Medical医療

創薬DX Platform特設サイト

新着情報

  • 2025.12.09 インフォメーション

    奥野教授がご講演されます。
    是非ご参加ください。
    令和7年度先導的学際研究機構創薬サイエンス部門シンポジウム
    基調講演「AIは創薬を変革できるか」

    ■日 時:2026年1月30日(金)13:00~16:00
    ■形 式:会場 & オンライン ハイブリッド開催
    ■会 場:大阪大学コンベンションセンター2階会議室3
    ■参加費:無料
    ■主 催:大阪大学先導的学際研究機構 創薬サイエンス部門
    ■後 催:国立研究開発法人日本医療研究開発機構(AMED)/日本製薬工業協会(製薬協)
    ■お申し込み参加フォーム
    ■お問い合わせ:大阪大学先導的学際研究機構 創薬サイエンス部門事務局 竹市 未帆
            E-mail:takeichi@phs.osaka-u.ac.jp

  • 2025.12.08 講演

    奥野教授が登壇しました。
    Healthtech Summit 2025
    2025/12/8 室町三井ホール&カンファレンス(COREDO室町テラス3F)
    セッション「高速化する創薬の現在地-In Silicoが実現する新しい創薬・臨床開発」

  • 2025.12.01 報道

    奥野教授の取材記事がミクスOnlineで紹介されました。
    2025年12月1日
    Outside View「鬼滅の刃×創薬AI研究 異色のコラボ

  • 2025.11.26 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    千葉峻太朗, 邦武克彦, 青木吉嗣, 横田俊文, 奥野恭史, 
    「AIモデルによるエクソンスキッピングアンチセンス核酸の活性予測―ゲノム基盤モデルに基づく解析」
    2025年度疾患モデルを駆使した筋ジストロフィーの治療法開発研究班会議, 2025/11/26, 国立精神神経医療研究センター教育研修棟ユニバーサルホール

  • 2025.11.25 講演

    奥野教授が講演しました。
    Oncology Crosstalk Symposium 2025
    2025/11/25 ウェビナー形式のオンライン開催
    「AI が拓くデータ駆動型医療の未来」

  • 2025.11.25 インフォメーション

    奥野教授のエッセイが京都大学大学院医学研究科ホームページに掲載されました。
    ニュース一覧:https://www.med.kyoto-u.ac.jp/news/
    リレーエッセイ:
    https://www.med.kyoto-u.ac.jp/news/25580
    リレーエッセイ一覧:
    https://www.med.kyoto-u.ac.jp/relay-essay/

  • 2025.11.23 講演

    奥野教授が講演しました。
    第35回日本医療薬学会年会
    2025/11/23 神戸国際会議場 1F メインホール
    特別講演3「AI/DXが拓くデータ駆動型創薬・医療」

  • 2025.11.21 講演

    奥野教授が滋賀医科大学にて講義を行いました。
    滋賀医科大学医学部医学科「医学特論」
    2025/11/21 滋賀医科大学 臨床講義棟
    「ビッグデータ・AI医療が拓く医療の未来」

  • 2025.11.20 報道

    奥野教授が取材協力した内容がテレビ番組で放送されました。(2025年11月20日)
    フジテレビ「イット!」 「インフルエンザ感染しやすい“5つのタイプ”ビッグデータ解析で明らかに」

  • 2025.11.18 講演

    奥野教授が講演しました。
    第9回ケモインフォマティクス秋の学校
    2025/11/18 奈良春日野国際フォーラム 能楽ホール
    招待講演4「DX platform for target discovery and drug design」

  • 2025.11.10 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Ito S*, Koyama, T*, Matsumoto S, Kojima R, Okamoto Y, Kuroda M, Kawashima H, Watanabe R, Yonezawa T, Sumiyoshi T, Ikeda K, Mizuguchi K, Iwata H, Okuno Y, Improving ADME Prediction with Multitask Graph Neural Networks and Assessing Explainability in Lead Optimization, J Chem Inf Model, 65(21):11796-11803, 2025/11/10, Epub 2025 Oct 22, doi:10.1021/acs.jcim.5c00758

  • 2025.11.10 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Yuji Okamoto, Transformers for Time-Series Forecasting: A Comprehensive Survey through 2024, NOLTA, E17-N(1), 2026/1, (In press)

  • 2025.10.01 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Takashi Nakaoku, Shigenari Nukaga, Kouya Shiraishi, Kenta Hamabe, Akifumi Mochizuki, Yu Hamaguchi, Emi Ogawa, Nguyen Le, Yoko Shimada, Hanako Ono, Hitomi Nishinakamura, Yoshihisa Kobayashi, Junko Hamamoto, Ayako Ui, Mitsugu Araki, Yukari Sagae, Keiko Ohgino, Kai Sugihara, Satoshi Endo, Jun Miyakoshi, Yuichi Shiraishi, Hiroyuki Yasuda, Yasushi Okuno, Tatsuya Yoshida, Yasushi Goto, Yuichiro Ohe, Shun-ichi Watanabe, Yasushi Yatabe, Hiroyoshi Nishikawa, Ryuji Hamamoto, and Takashi Kohno, Mutation of CMTR2 in Lung Adenocarcinoma Alters RNA Alternative Splicing and Reveals Therapeutic Vulnerabilities, Nature Communications, 2025, (In press)

  • 2025.09.24 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Takuto Koyama, Hiroaki Iwata, Ryosuke Kojima, Takao Otsuka, Aki Hasegawa, Hiroshi Ueda, Toshiharu Morimoto, Ryoko Sasaki, Nao Torimoto, Sei Murakami, Manabu Tojo, Teruki Honma, Shigeyuki Matsumoto, Yasushi Okuno, Empowering Federated Learning for Robust Compound-Protein Interaction Prediction across Heterogeneous Cross-Pharma Domains, ChemRxiv, 2025/9/24, https://chemrxiv.org/engage/chemrxiv/article-details/68cbfe759008f1a46762e3e810.1371/journal.pone.0331650

  • 2025.09.09 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Yamamoto T*, Sakuragi M*, Tuji Y, Okamoto Y, Uchino E, Yanagita M, Muto M, Kamada M, Okuno Y, Predicting mortality dynamics in cancer patients: A machine learning approach to pre-death events, PLoS One, 20(9):e0331650, 2025/9/9, doi:10.1371/journal.pone.0331650

  • 2025.09.04 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Minoru Sakuragi, Riko Asada, Mayumi Kamada, Yasushi Okuno, Multimodal Gene–Environment Modeling of Disease Onset Using a Context-Aware Genome Language Model, Proceedings of IIBMP 2025(Oral Presentation (Peer-reviewed)), 2025/9/4

  • 2025.08.01 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Sakuragi M, Suzuki H, Sumitomo R, Ishimura T, Hayashi A, Kakita H, Niwa A, Higashi Y, Huang C, Matsubara T, & Tsukamoto T, Identifying Multiple Pleuroperitoneal Communications by Computed Tomography Peritoneography, Kidney International, 108(2):332, 2025/8, doi:10.1016/j.kint.2025.03.024

  • 2025.07.29 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Shuntaro Chiba , Yasushi Okuno, In Silico Prediction and Selection of Exon-Skipping Antisense Oligonucleotide Sequences Using eSkip-Finder, Methods Mol Biol., 2025;2964:109-116, 2025/7/29, doi:10.1007/978-1-0716-4730-1_6

  • 2025.07.01 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Akada M, Tabuchi H, Okamoto Y, Tanabe M, Nishikawa R, Yamane S, Tsujikawa A, Okuno Y, Quantitative Assessment of Microsurgical Skill in Intrascleral Fixation Surgery Using Wearable Strain Sensors: A Pilot Study, Transl Vis Sci Technol., 14(7):7, 2025/7/1, doi:10.1167/tvst.14.7.7

  • 2025.06.05 論文

    奥野Gメンバーの研究論文が発表されました

    Sho Oshima*, Yuji Okamoto*, Taisei Tosaki, Ryosuke Kojima, Yasushi Okuno (*Equal Contribution), Supervised Graph Contrastive Learning for Gene Regulatory Network, arXiv:2505.17786v2 , 2025/6/5, https://arxiv.org/pdf/2505.17786

  • 2025.12.09 インフォメーション

    奥野教授がご講演されます。
    是非ご参加ください。
    令和7年度先導的学際研究機構創薬サイエンス部門シンポジウム
    基調講演「AIは創薬を変革できるか」

    ■日 時:2026年1月30日(金)13:00~16:00
    ■形 式:会場 & オンライン ハイブリッド開催
    ■会 場:大阪大学コンベンションセンター2階会議室3
    ■参加費:無料
    ■主 催:大阪大学先導的学際研究機構 創薬サイエンス部門
    ■後 催:国立研究開発法人日本医療研究開発機構(AMED)/日本製薬工業協会(製薬協)
    ■お申し込み参加フォーム
    ■お問い合わせ:大阪大学先導的学際研究機構 創薬サイエンス部門事務局 竹市 未帆
            E-mail:takeichi@phs.osaka-u.ac.jp

  • 2025.11.25 インフォメーション

    奥野教授のエッセイが京都大学大学院医学研究科ホームページに掲載されました。
    ニュース一覧:https://www.med.kyoto-u.ac.jp/news/
    リレーエッセイ:
    https://www.med.kyoto-u.ac.jp/news/25580
    リレーエッセイ一覧:
    https://www.med.kyoto-u.ac.jp/relay-essay/

  • 2025.09.22 インフォメーション

    このたび、京都大学 医学研究科・薬学研究科 理化学研究所 奥野研究室にゆかりのある卒業生・関係者の皆様を対象とした同門会「蝶舞会」を設立し、第1回目の同門会を開催する運びとなり、9月13日(土)にフォーシーズンズホテル京都にて、京都⼤学・理化学研究所 奥野研究室 同⾨会「蝶舞会(かれんかい)」が 開催されました。

    本会は、研究室でのご縁を大切にしながら、会員同士の交流を深め、学術的・社会的な発展を共に目指すことを目的としており、「蝶舞会」は一門をとても大切にしていた平家の蝶紋より由来しております。

    第1回目の同門会当日は100名以上の方にお集まりいただき、研究の話や各自の近況報告など、様々な交流が見受けられ、とても盛大な会となりました。
    ご参加いただきました皆様、心よりお礼申し上げます。

     

  • 2025.06.27 インフォメーション

    創薬DX Platform特設サイトを開設しました。 人工知能(AI)とシミュレーション技術を互いに連結・連動させ、創薬プロセス全体の予測と自動化を目指す我々の取り組み “創薬DX Platform(ディーエックス プラットフォーム)” を紹介する情報サイトを開設し、本日公開しました。創薬AIに関する入門ガイドや気軽に試せるデモ、最新研究事例・プロジェクト紹介などを通じて、創薬DXの最前線を発信していきます。 創薬DXポータル:https://3dxpf.med.kyoto-u.ac.jp

  • 2025.03.17 インフォメーション

    奥野教授が講演しました。
    第36回 製薬協政策セミナー 日本の創薬力向上を目指して
    講演3「日本の創薬とDX」

    ■日 時:2025年3月17日(月)13:00~16:00
    ■形 式:会場 & オンライン ハイブリッド開催
    ■会 場:室町三井ホール&カンファレンス(東京都中央区日本橋室町3-2-1 CORED室町テラス 3階
    ■受講費:無料
    ■定 員:【会場】120名
    ■主 催:日本製薬工業協会
    ■共 催:日本経済新聞社
    ■お申し込み参加フォーム ※締切り:【会場聴講】3月9日(日)【オンライン聴講】3月16日(日)
    ■お問い合わせ:製薬協政策セミナー事務局
            https://conf1.nep-sec.jp/form/bfb6wP

  • 2023.05.25 インフォメーション

    奥野教授が代表のライフインテリジェンスコンソーシアム(LINC)がLINC SHOWCASE 2023 Summerを開催(オンライン)します。
    日  時:2023年7月3日(月) 13:00~16:00
    申し込み:申し込みフォーム  6月27日(火)締め切り
    内  容:講演「DX の日本の現状と対応策(仮)」デジタル庁 統括官 村上敬亮 氏、パネル討論「創薬DX プラットフォームの展望(仮)

  • 2023.03.07 インフォメーション

    奥野教授が課題代表である「富岳」成果創出加速プログラム「プレシジョンメディスンを加速する創薬ビッグデータ統合システムの推進」でワークショップを開催しました。
    「富岳」で目指すシミュレーション・AI駆動型次世代医療・創薬
    2023/3/9 ハイブリッド 開催

  • 2022.08.03 インフォメーション

    奥野教授が講演します。
    神戸リサーチコンプレックス協議会シンポジウム 市民の健康データを活用したデータサイエンスの社会実装
    「AI が拓くデータ駆動型ヘルスケアの未来」

    ■日 時:2022年8月26日(金)14:00~17:00(17:00~名刺交換会予定)
    ■形 式:リアル&ZOOMウェビナー開催 ※新型コロナウイルスの感染状況次第でオンライン開催のみになる可能性があります。
    ■会 場:三井住友銀行 神戸本部ビル 3階 大会議室 (兵庫県神戸市中央区浪花町 56)
    ■主 催:神戸リサーチコンプレックス協議会
    ■共 催:株式会社三井住友銀行
    ■参加費:無料
    ■お申し込み参加フォーム(締切8/24)
    ■お問い合わせ:神戸リサーチコンプレックス協議会事務局(神戸市)
    kobecity-rc@office.city.kobe.lg.jp
    ■詳細はこちら

  • 2022.05.12 インフォメーション

    大学院へ入学を希望する方を対象に、大学院説明会 を開催します。

    主催: 京都大学大学院 医学研究科 人間健康科学系専攻 総合医療科学コース

    日時: 2022年 5月 28日 (土) 13:00〜15:00

    場所: Zoom にて開催

    詳細:https://mms.hs.med.kyoto-u.ac.jp/

  • 2021.02.10 インフォメーション

    COVID-19重症者予測と地域間医療シェアリングの最適化シミュレーションの最新結果

    2021年2月10日現在,日本全国のコロナ感染者数は減少傾向です.そのため,2021年2月10日を持ちまして,更新を終了させていただきます.

    2021年02月07日予測結果

    2021年02月06日予測結果

    2021年02月05日予測結果

    2021年02月03日予測結果

  • 2025.12.09 インフォメーション

    奥野教授がご講演されます。
    是非ご参加ください。
    令和7年度先導的学際研究機構創薬サイエンス部門シンポジウム
    基調講演「AIは創薬を変革できるか」

    ■日 時:2026年1月30日(金)13:00~16:00
    ■形 式:会場 & オンライン ハイブリッド開催
    ■会 場:大阪大学コンベンションセンター2階会議室3
    ■参加費:無料
    ■主 催:大阪大学先導的学際研究機構 創薬サイエンス部門
    ■後 催:国立研究開発法人日本医療研究開発機構(AMED)/日本製薬工業協会(製薬協)
    ■お申し込み参加フォーム
    ■お問い合わせ:大阪大学先導的学際研究機構 創薬サイエンス部門事務局 竹市 未帆
            E-mail:takeichi@phs.osaka-u.ac.jp

  • 2025.12.08 講演

    奥野教授が登壇しました。
    Healthtech Summit 2025
    2025/12/8 室町三井ホール&カンファレンス(COREDO室町テラス3F)
    セッション「高速化する創薬の現在地-In Silicoが実現する新しい創薬・臨床開発」

  • 2025.11.25 講演

    奥野教授が講演しました。
    Oncology Crosstalk Symposium 2025
    2025/11/25 ウェビナー形式のオンライン開催
    「AI が拓くデータ駆動型医療の未来」

  • 2025.11.23 講演

    奥野教授が講演しました。
    第35回日本医療薬学会年会
    2025/11/23 神戸国際会議場 1F メインホール
    特別講演3「AI/DXが拓くデータ駆動型創薬・医療」

  • 2025.11.21 講演

    奥野教授が滋賀医科大学にて講義を行いました。
    滋賀医科大学医学部医学科「医学特論」
    2025/11/21 滋賀医科大学 臨床講義棟
    「ビッグデータ・AI医療が拓く医療の未来」

  • 2025.11.18 講演

    奥野教授が講演しました。
    第9回ケモインフォマティクス秋の学校
    2025/11/18 奈良春日野国際フォーラム 能楽ホール
    招待講演4「DX platform for target discovery and drug design」

  • 2025.11.14 講演

    奥野教授が講演しました。
    IQVIA RWE Seminar
    2025/11/14 オンライン開催
    基調講演1「RWDを活用した生成AI基盤モデルの開発」

  • 2025.11.09 講演

    奥野教授が講演しました。
    第38回南東北連合学術学会
    2025/11/9 一般財団法人脳神経疾患研究所附属 総合南東北病院(福島県郡山市)
    「医療におけるAIの現状と未来」

  • 2025.10.22 講演

    峰晴陽平 特定准教授が講演しました。
    第123回 近畿脳腫瘍病理検討会
    2025/10/22 エーザイ株式会社 大阪コミュニケーションオフィス
    会長講演「悪性脳腫瘍の微小環境からみた治療戦略~てんかんとの関連性」

  • 2025.10.20 講演

    内野詠一郎 特定准教授が講演しました。
    第22回DIA 日本年会2025
    2025/10/20 東京ビッグサイト
    S11「革新的なイノベーションで目指す創薬と医療の未来-ライフインテリジェンスコンソーシアム LINCの取り組み」
    「デジタルヘルスデータ基盤構築ー全国各地のコホートデータとの連携プラットフォームを目指して」

  • 2025.11.26 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    千葉峻太朗, 邦武克彦, 青木吉嗣, 横田俊文, 奥野恭史, 
    「AIモデルによるエクソンスキッピングアンチセンス核酸の活性予測―ゲノム基盤モデルに基づく解析」
    2025年度疾患モデルを駆使した筋ジストロフィーの治療法開発研究班会議, 2025/11/26, 国立精神神経医療研究センター教育研修棟ユニバーサルホール

  • 2025.10.31 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    峰晴陽平, 
    シンポジウム32「未来の脳血管障害の治療」
    「免疫制御に基づくコンパニオン診断薬による閉塞性脳血管障害の治療」
    日本脳神経外科学会第84回学術総会, 2025/10/31, パシフィコ横浜

  • 2025.10.29 学会発表

     

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    【ポスター発表】
    Takuto Koyama, Hiroaki Iwata, Ryosuke Kojima, Takao Otsuka, Aki Hasegawa, Teruki Honma, Shigeyuki Matsumoto, Yasushi Okuno, “Empowering Federated Learning for Robust Compound-Protein Interaction Prediction across Heterogeneous Cross-Pharma Domains“, 情報計算化学生物学会2025年大会(CBI2025), 2025/10/28-29, タワーホール船堀

    【口頭発表】
    SEUNGEON LEE, Takuto Koyama, Itsuki Maeda, Shigeyuki Matsumoto, Yasushi Okuno, “HELM-BERT: A Transformer for Medium-sized Peptide Property Prediction“, 情報計算化学生物学会2025年大会(CBI2025), 2025/10/29, タワーホール船堀

    Shuhei Tanaka, Taisei Tosaki, Nanae Aratake, Eiichiro Uchino, Yasushi Okuno, “Development of a Predictive Model for Type 2 Diabetes Onset Using Life Log and Health Checkup Data“, 情報計算化学生物学会2025年大会(CBI2025), 2025/10/29, タワーホール船堀

  • 2025.10.29 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    峰晴陽平, 
    一般演題口演「AIアプリを用いた特定保健指導の効果とその持続性:単アーム試験の結果から」
    第84回日本公衆衛生学会総会, 2025/10/29, 静岡県コンベンションアーツセンター

  • 2025.10.07 学会発表

    奥野Gメンバーが学会でポスター発表を行いました。

    Mineharu Y,  Uchino E,  Watanabe H, Hirai K, Yoshida A, Kojima R, Okuno Y, 
    “AI-Assisted Specific Health Guidance App for Lifestyle Disease Prevention and Stroke Prevention”
    European Association of Neurosurgical Societies 2025, 2025/10/7, Vienna, Austria

  • 2025.02.06 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    Mineharu Y, Kamata T, Tomoto M, Sato N, Tamada Y, Funaki T, Oichi Y, Harada KH, Koizumi A, Kimura T, et al., 
    “Peripheral blood GATA2 expression increases RNF213 mutation penetrance and clinical severity in moyamoya disease”
    International Stroke Conference, 2025/2/6, Los Angeles Convention Center | Los Angeles, California

  • 2025.01.23 学会発表

    奥野Gメンバーが学会でポスター発表を行いました。

    S Chiba, T Yamane, M Ikeguchi, M Ohta, 
    “Parallel Bayesian Optimization of Atomic-Level Interaction Descriptors for Protein Modeling”
    The 7th R-CCS International Symposium, 2025/1/23, KOBE International Conference Center

  • 2025.01.22 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    峰晴陽平, 奥野恭史, 
    シンポジウム
    「AIによる過去・現在・未来の可視化がもたらすヘルスケア・医療イノベーション」
    第2回 Medical Innovation Centerで拓く未来医療のためのデジタルイノベーション, 2025/1/22,

    京都大学メディカルイノベーションセンター 1階セミナー室開催およびZoom配信(ハイブリッド開催)

  • 2024.12.18 学会発表

    奥野Gメンバーが学会で発表を行いました。

    小山 拓豊, 津村 颯人, 沖田 龍之介, 山崎 公裕, 河東 孝, 長谷川 亜樹, 岩田 浩明, 小島 諒介, 松本 篤幸, 奥野 恭史, 
    「ケミカルゲノミクス言語モデルを用いた化合物-タンパク質間相互作用の大規模予測」
    第47回ケモインフォマティクス討論会, 2024/12/18, 金沢商工会議所会館

  • 2024.12.13 学会発表

    奥野Gメンバーが学会でポスター発表を行いました。

    A Kikuchi, T Ekimoto, T Yamane, S Chiba, K Shimizu, S Fujii, M Ikeguchi, 
    “Antigen recognition by predicting the three-dimensional structure of killer T cell-derived T cell receptors”
    第52回構造活性相関シンポジウム, 2024/12/12-13, 川崎市産業振興会館